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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 蛋白质相互作用
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落木778

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质相互作用 已有3人参与

本人正在用DS做蛋白质相互作用，应用蛋白质对接技术未成功；因此设想使用分子对接技术libdock和flexible docking技术，设定其中一种大分子蛋白为受体，但配体蛋白的格式是.pdb  如何变成.sd 的格式。不知道用这两种方法做蛋白质对接是否可行，急需，谢谢各位。
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1楼 2015-05-22 10:41:36
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与，应助指数 +1
可以考虑用HEX 或者 ZDOCK等软件
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2楼2015-05-22 21:22:25
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
OpenBabel可用来转化多种格式

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2015-05-23 06:54:35
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

推荐Z-Dock或者ICM-Docking，不过话说DS的蛋白-蛋白对接就是z-dock，不过是加了个图形界面而已，可以试一下ICM
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4楼2015-06-11 16:15:31
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