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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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落木778

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质相互作用 已有3人参与

本人正在用DS做蛋白质相互作用,应用蛋白质对接技术未成功;因此设想使用分子对接技术libdock和flexible docking技术,设定其中一种大分子蛋白为受体,但配体蛋白的格式是.pdb  如何变成.sd 的格式。不知道用这两种方法做蛋白质对接是否可行,急需,谢谢各位。
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
可以考虑用HEX 或者 ZDOCK等软件
2楼2015-05-22 21:22:25
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
OpenBabel可用来转化多种格式

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-05-23 06:54:35
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

推荐Z-Dock或者ICM-Docking,不过话说DS的蛋白-蛋白对接就是z-dock,不过是加了个图形界面而已,可以试一下ICM
4楼2015-06-11 16:15:31
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