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seewindow

新虫 (小有名气)

[求助] 如何验证RNA是否与蛋白质发生相互作用?

如何验证某个RNA分子是否与蛋白质相互作用呢?
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斯多格格

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking(金币+3): 鼓励发帖交流! 2012-02-06 18:12:25
研究RNA与蛋白的相互作用一般用三杂交系技术。三杂交系统的基本原理是将一个已知的RNA结合蛋白与转录因子的DNA结合domain构建第一个融合蛋白,第二种蛋白(待选的RNA结合蛋白)与转录激活结构域构建融合蛋白。此外构建和表达一杂合RNA,含有二个不同的结合位点。当RNA与二个RNA结合蛋白的结合位点相互作用时可激活报道基因的转录和表达。报道基因表达与否来看RNA与蛋白是否发生了作用。
书自香我何须花
2楼2012-02-06 17:01:45
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huangglen

铁杆木虫 (正式写手)

免疫共沉淀吧
3楼2012-02-06 22:58:18
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huangglen

铁杆木虫 (正式写手)

免疫共沉淀吧
4楼2012-02-06 22:58:53
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huangglen

铁杆木虫 (正式写手)

免疫共沉淀吧
5楼2012-02-06 22:59:14
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huangglen

铁杆木虫 (正式写手)

看天: 不要重复 2012-02-07 10:00:45
免疫共沉淀吧
6楼2012-02-06 23:02:36
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unique133

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
看天(金币+2): 鼓励回答 2012-02-07 10:00:56
可能是这样做
1.如果蛋白质有RNA酶的作用,直接验证RNA是否降解。(用另一个蛋白没有RNA酶活性的做一个负对照)
2.把RNA与蛋白质混合跑电泳。如果RNA与蛋白质相互作用,则影响蛋白质的迁移。
7楼2012-02-07 09:53:54
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nasi

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。具体你再查查吧。不知道是否有用。祝好运。
8楼2012-02-07 10:50:04
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niushuaiji

金虫 (正式写手)

不放弃的小鸟

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
目前了解到的RNA的功能,酶学功能和tRNA mRNA siRNA可能会与蛋白质作用,可以试着从这些角度考虑
Tobeornottobe,that'saproblem
9楼2012-02-07 13:05:45
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