24小时热门版块排行榜    

查看: 1217  |  回复: 4

a406331686

银虫 (小有名气)

[求助] 全长PCR扩增的非特异性条带去不掉咋办 已有3人参与

上下引物的TM值分别为43.6和48.2,我用的是44度每个循环降0.5度,一共降12个循环,然后再用38度,跑20个循环,可是电泳后发现目的条带(1000bp处)有,但是没有750bp处的非特异性条带清楚,而且升高退火温度也没作用,求大神指点····

全长PCR扩增的非特异性条带去不掉咋办
CAD4_副本.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
a406331686: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-03-25 10:19:20
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-25 10:42:04
TM值分别为43.6和48.2
引物的Tm低到40oC,你每条引物各有多少个碱基?
PCR的引物不仅仅要考虑Tm,还要考虑碱基数,因为本质上控制特异性的是碱基长度,
对于人的基因组,引物一般要求至少19个碱基,如果Tm再很低,继续延长,如果Tm已经很高了,为了保证引物的“复杂度”,也应该保持在19个碱基以上。
不然错配是必然的。
但是你这个情况可能比较特殊,你是做克隆,
做克隆只要有自己要的条带就行了
关键是你那个目的条带是不是你要的
如果是的,你就想办法纯化回来一点,再P好了
2楼2014-03-25 09:22:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a406331686

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-25 09:22:38
TM值分别为43.6和48.2
引物的Tm低到40oC,你每条引物各有多少个碱基?
PCR的引物不仅仅要考虑Tm,还要考虑碱基数,因为本质上控制特异性的是碱基长度,
对于人的基因组,引物一般要求至少19个碱基,如果Tm再很低 ...

上下游引物分别为     TGGTTTACAGTTTTACATAC                              GGTACGATGATTCAAACG,上游引物为20个碱基,如果再加碱基的话,引物就有错配了。
3楼2014-03-25 10:10:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-25 13:29:47
把体系做大一点,然后切胶回收大小对的那个片段,之后送测序,对的话就可以了,不用管引物好不好。要是测序不对再考虑引物。
4楼2014-03-25 12:09:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shen_41745

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
a406331686: 金币+2, 有帮助 2014-03-26 18:17:37
你这目的条带看的到而且还比较亮,切胶回收,纯化应该能得到目的带的,然后连T,转大肠,送测序,至于其他的杂带有多亮你就不用管啦
5楼2014-03-26 09:36:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 a406331686 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +5 布布和一二 2026-08-08 8/400 2026-08-08 14:54 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见