24小时热门版块排行榜    

查看: 2196  |  回复: 8

fxj1986

木虫 (正式写手)


[交流] 酶切酶连转化后单克隆检测不对

自己构建的载体,片段7K左右;片段(3k)通过PCR扩增;电泳后回收进行酶切,酶切条件37℃,3h;再电泳后回收,酶连时载体:片段=1:1.5左右,转化DH5α,16h(氯霉素抗性)平板上单克隆很多;挑取单克隆进行菌落PCR验证(引物为自己设计),电泳结果显示除了目的条带外还有其他条带;对单克隆培养重新提取质粒进行双酶切后,只检测出一条带(与质粒大小基本一致),没有片段的目的条带。几次转化都如此,求分析,求经验!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kk26

木虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fxj1986: 金币+1, 谢谢,同勉 2012-10-12 22:34:40
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-13 16:30:16
做过以未连入片段的质粒为模板的阴性对照PCR吗?怀疑你没有连入片段,pcr筛菌出来的并非阳性克隆。

我目前也筛不到阳性克隆,同样郁闷,继续做做!
同祝好运!
2楼2012-10-12 17:28:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

酶切专家

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fxj1986: 金币+3, 谢谢 2012-10-12 22:35:36
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-13 16:30:30
应该是载体酶切不完全(没有完全进行双酶切)。不知道你用的是什么酶。不同酶的用量会差5-30倍。你可以用double digestion designer设计你的酶切实验,确保载体酶切完全,基本没有背景克隆。你可以在小木虫上搜到的。祝好运。
3楼2012-10-12 20:32:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

faile18

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fxj1986: 金币+1, 引物是一样的,正在改变酶切条件 2012-10-13 10:26:32
小丹木木: 金币+3, 光路交流 2012-10-13 16:30:40
小丹木木: 操作失误,不好意思 2012-10-13 16:31:02
有点疑问,也有点小建议:
1. 可以考虑蓝白斑筛选,初步滤掉空载体,白色克隆PCR检测,(这里有个疑问,你PCR验证时说引物自己设计,不知道你这对引物与你之前PCR扩增3K片段时是否一样,如果不一样可以考虑用那对引物扩增来检测一下)。
2. 确定下质粒双酶切体系是否兼容,比如buffer,酶用量等都会有影响。
3. 你的载体自身是否work?
祝好运。
4楼2012-10-13 04:15:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fxj1986: 金币+1 2012-10-13 10:26:43
首先确保用的两个酶没问题。酶切完用碱性磷酸酶处理载体减少自连。菌落PCR时做负对照。
5楼2012-10-13 08:41:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
fxj1986: 金币+1, 谢谢,正在调整比例 2012-10-13 10:27:03
载体本身也有抗性?还是抗生素失效?
可以考虑增大连接时目的基因的量
6楼2012-10-13 09:37:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zqp9110

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-13 16:31:14
fxj1986: 金币+1, 谢谢建议 2012-10-14 10:23:43
连接时插入片段和载体的比例可能要大一点才能增加连接效率吧。建议连接结束后把连接产物先进行电泳检测,看是否有插入了目的片段的完整载体,每一步都加入质控能减少不必要的工作量。
7楼2012-10-13 10:46:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20083630zhan

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by zqp9110 at 2012-10-13 10:46:44
连接时插入片段和载体的比例可能要大一点才能增加连接效率吧。建议连接结束后把连接产物先进行电泳检测,看是否有插入了目的片段的完整载体,每一步都加入质控能减少不必要的工作量。

这样也可以吗?连接产物本来就非常少,电泳能看出条带吗?
8楼2014-03-03 16:08:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
酶连时载体:片段=1:1.5????我们一般是载体:片段的摩尔数=1:3~1:10.
9楼2014-03-03 17:12:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fxj1986 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我面上完蛋了 +10 且听虎啸 2026-08-20 11/550 2026-08-25 07:12 by echo8914667
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-25 01:47 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见