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yishu2012

金虫 (小有名气)

[求助] 克隆做不出来,求帮助

做克隆一个月了,始终有两个做不出来。都是大约2000bp的长度。
1.载体:pFASTbac-gp67
   感受态:DH5a
   用BamHI和XhoI双酶切
   酶切37度,4小时
   连接有时候过夜连,菌落很少,而且菌液pcr P不出来。
2.载体:pFASTbac-Hem
感受态:DH5a
   用BglII和XhoI双酶切
   酶切37度,4小时
   连接有时候过夜连,菌落很少,而且菌液pcr P不出来
酶切体系:回收片段43ul  酶1.2各1ul buffer 5ul BSA 0.5ul
连接体系:回收酶切产物 12ul T4连接酶1ul buffer 1.5ul 载体 0.5ul
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raindick1231

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
检查引物 合成对不对
先克隆到T载体上
然后不是要测序
顺便看看没且位点对不对
大概会多花2-3天时间,不过实验能成功就成
2楼2013-01-23 19:56:24
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raindick1231

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by raindick1231 at 2013-01-23 19:56:24
检查引物 合成对不对
先克隆到T载体上
然后不是要测序
顺便看看没且位点对不对
大概会多花2-3天时间,不过实验能成功就成

有一次华大基因给我合成错了 让我挨了多少骂。。。。我一年都没在那合引物
3楼2013-01-23 20:08:21
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 果然是专家 2013-01-29 08:35:44
克隆时一般需要设置一个载体自连对照,用于分析载体本身是否酶切完全。
还需要明确感受态细胞是否正常。
如果载体或外源片段酶切不完全,也会导致克隆失败,建议你用double digestion designer设计双酶切,以确保载体和你的目的基因片段酶切完全,提高克隆效率,减少假阳性背景克隆。
如果都正常,那就要考虑是否克隆的基因对大肠杆菌有毒性(基因水平或蛋白质水平)。由于毒性的原因,对导致很多基因在原核表达载体上克隆不成功。

祝好运!
4楼2013-01-23 22:01:09
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普通回帖

yishu2012

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by raindick1231 at 2013-01-23 20:08:21
有一次华大基因给我合成错了 让我挨了多少骂。。。。我一年都没在那合引物...

引物检查过了,完全没有问题!
5楼2013-01-24 13:45:12
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yishu2012

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 酶切专家 at 2013-01-23 22:01:09
克隆时一般需要设置一个载体自连对照,用于分析载体本身是否酶切完全。
还需要明确感受态细胞是否正常。
如果载体或外源片段酶切不完全,也会导致克隆失败,建议你用double digestion designer设计双酶切,以确保 ...

谢谢了,关键问题在于我那个比较奇怪,因为同样的片段也有连别的载体,都是没问题的,但是连这个载体就不行了
6楼2013-01-24 13:46:27
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xinmiao94

禁虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

7楼2013-01-24 15:27:35
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XOooZzz

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
xhoi的说明书上有一段:因该酶切出的突出末端比一般的4 个碱基突出末端的连接效率低,
所以必须使用平滑末端的连接条件。
8楼2013-01-24 15:44:06
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yishu2012

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by XOooZzz at 2013-01-24 15:44:06
xhoi的说明书上有一段:因该酶切出的突出末端比一般的4 个碱基突出末端的连接效率低,
所以必须使用平滑末端的连接条件。

那个连接体系是什么啦?
9楼2013-01-24 17:26:10
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yishu2012

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xinmiao94 at 2013-01-24 15:27:35
先连T 载体,测序正确后,酶切再连pFASTbac-gp67,连接时,注意目的基因和载体的mol数比例。

比例应该是多少
10楼2013-01-24 17:26:24
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