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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

[求助] 定量PCR跑出来没有CT值,怎么回事 已有4人参与

跑了两个样做标准曲线,跑完结果第一个样就没有检测到CT值,怎么回事?两个样品就引物不一样,其他都一样啊。刚接触定量PCR,求教
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天道酬勤
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
随风飘摇11: 金币+2, 有帮助 2015-05-03 18:13:24
首先你要确认你的这对引物是否适合在你这个反映程序中扩增,可用凝胶电泳检测引物的特异性、退火温度等等。如果引物合适,再确认这个探针是否在所测样品中有表达,如果本身就没有表达或者表达量极低,也是无法检测的。祝好运。
2楼2015-05-03 15:53:10
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-05-03 15:53:10
首先你要确认你的这对引物是否适合在你这个反映程序中扩增,可用凝胶电泳检测引物的特异性、退火温度等等。如果引物合适,再确认这个探针是否在所测样品中有表达,如果本身就没有表达或者表达量极低,也是无法检测的 ...

怎么检测引物是否合适?定量的引物也可能用来做普通的PCR扩增吗?

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天道酬勤
3楼2015-05-03 18:13:10
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晞朔

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2015-05-03 18:13:10
怎么检测引物是否合适?定量的引物也可能用来做普通的PCR扩增吗?
...

可以。用凝胶电泳就可以
4楼2015-05-03 18:14:53
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-05-03 18:14:53
可以。用凝胶电泳就可以...

老实说,定量引物做半定量都不行,半定量不就是普通PCR吗?你这样做过吗

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天道酬勤
5楼2015-05-03 18:19:06
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晞朔

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2015-05-03 18:19:06
老实说,定量引物做半定量都不行,半定量不就是普通PCR吗?你这样做过吗
...

片段多大??
6楼2015-05-03 18:20:08
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-05-03 18:20:08
片段多大??...

基因全长1700bp。但不是说定量的引物只有80-400bp设计的吗?引物是我老师设计的

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天道酬勤
7楼2015-05-03 18:32:32
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晞朔

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 随风飘摇11 at 2015-05-03 18:32:32
基因全长1700bp。但不是说定量的引物只有80-400bp设计的吗?引物是我老师设计的
...

是可以检测的。用琼脂糖凝胶电泳检测下
8楼2015-05-03 19:36:15
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violin0313

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可能是定量程序没设定对,完全按照你跑出CT值的那个程序跑
9楼2015-05-04 11:17:51
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by violin0313 at 2015-05-04 11:17:51
可能是定量程序没设定对,完全按照你跑出CT值的那个程序跑

两个程序一样的,一块儿跑的

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天道酬勤
10楼2015-05-04 12:04:38
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