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Lopick

新虫 (初入文坛)

[求助] 双酶切得到的500bp的片段回收效果不好,是怎么个情况? 已有6人参与

我的质粒全长3000多bp   双酶切后得到2000bp和500bp两个片段  可是前者亮度较好  后者亮度较浅    要回收500bp  可是回收后跑胶没条带   请问各位大神  这是神马情况啊???

双酶切得到的500bp的片段回收效果不好,是怎么个情况?
ab shuangmeiqie2014-10-23 16hr 55min_副本.jpg
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Lopick: 金币+1 2014-11-02 16:44:17
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-11-02 21:59:54
你可以看一下成像的原理,小片段相对大片段不亮是合理的,你可以增加以下模板的量,因为回收本来就有一定的效率,目的片段太少了,回收过程中损失太多了……
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
2楼2014-11-02 00:04:06
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Thomas_T

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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Lopick: 金币+2 2014-11-02 16:44:06
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-11-02 22:00:01
小片段回收是比较麻烦,我前段时间也出现过这个问题,首先应该用试剂盒给的TE,因为TE是弱碱性的,有利于DNA的溶解,我前段时间用灭菌水要过一直不好,因为这个水有点偏酸性了。。另外,在最后一步离心下来的DNA溶液再放到柱子上离心一下,这样会提高回收率。当然了,最后加TE的时候最好60度预热一下。
祝你成功~
3楼2014-11-02 09:53:16
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dongdekun

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Lopick: 金币+1 2014-11-02 16:44:11
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-11-02 22:00:06
目测质粒浓度太低,增加酶切质粒的量是最有效的解决办法。。。
另外,我一般回收后都直接测定浓度,不再跑电泳检测的。
4楼2014-11-02 13:07:34
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myheat

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
只要有就可以往下做,不必在意量。大不了下步连接全部加上

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-11-02 16:40:58
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Lopick

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Thomas_T at 2014-11-02 09:53:16
小片段回收是比较麻烦,我前段时间也出现过这个问题,首先应该用试剂盒给的TE,因为TE是弱碱性的,有利于DNA的溶解,我前段时间用灭菌水要过一直不好,因为这个水有点偏酸性了。。另外,在最后一步离心下来的DNA溶液 ...

你好  很感谢你的答复  方便留个联系方式吗?  最近做的有点不顺利,想请教您一下。
6楼2014-11-02 16:43:56
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289363400

铁杆木虫 (知名作家)

凌乱前进方向

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有的时候即使看不到条带也能出来结果的,多试几次看看。
7楼2014-11-02 17:05:32
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Thomas_T

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Lopick at 2014-11-02 16:43:56
你好  很感谢你的答复  方便留个联系方式吗?  最近做的有点不顺利,想请教您一下。...

1007065296
8楼2014-11-02 20:52:12
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圆yy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2014-11-02 22:00:23
Lopick: 金币+1 2014-11-03 08:33:16
1、目测你的酶切好像不完全,多切点时间不急做分子实验
2、凝胶回收注意:低温核酸容易结合在柱子上,所以溶胶液可以冷却在4°冰箱2min,然后离心。
3、高温核酸易分离,所以用60°的洗脱液洗脱,那么你得到的回收率可以达到90%以上
暂时给你这么多意见吧
9楼2014-11-02 21:57:11
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