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lmc2537

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关 已有2人参与

初学QPCR,请大家多多指教,已经问过实验室的师兄了,不过依然有一些问题,还是不明白,
师兄说溶解曲线里是看不出引物二聚体峰的,但是我的空白对照三复孔之一出现了一个峰,我怀疑是引物二聚体峰。最后希望大家帮我分析下,我这个引物能用吗?或者如何改变PCR条件?在此谢谢木虫的朋友们了!
附图如下:

求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关
扩增曲线


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-1
扩增效率图


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-2
模板10倍稀释溶解曲线峰


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-3
模板100倍稀释溶解曲线峰


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-4
模板1000倍稀释溶解曲线峰


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-5
模板10000倍稀释溶解曲线峰


求助qPCR,,引物的扩增效率,二聚体相关-6
空白对照溶解曲线峰
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呆的呆

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lmc2537: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-03 17:53:48
lmc2537: 金币+16 2014-09-29 20:26:25
楼主你好,我最近也在学习qpcr, 昨天刚做了一个标准曲线的实验。首先从你上的图看,你的pipetting还有待提高呀。尽量让三个repeat都重合,这样结果才可信。 从数值上来看 你的斜率不到3.3,扩增效率不是特别好。我的电脑只看到了模板稀释10倍的溶解曲线,只有一个主峰,应该没有引物二聚体的出现,你可以把做过qpcr的反应在电泳上跑下看看,是不是一条条带。。
我也是初学者,第一次回帖帮别人,希望能对你游泳呀!
小虾米和不倒翁
2楼2014-09-02 21:56:13
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lmc2537

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 呆的呆 at 2014-09-02 21:56:13
楼主你好,我最近也在学习qpcr, 昨天刚做了一个标准曲线的实验。首先从你上的图看,你的pipetting还有待提高呀。尽量让三个repeat都重合,这样结果才可信。 从数值上来看 你的斜率不到3.3,扩增效率不是特别好。我 ...

谢谢你的耐心解答!
3楼2014-09-03 17:53:33
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lmc2537: 金币+2 2014-09-04 14:49:06
lmc2537: 金币+2 2014-09-29 20:26:30
不是引物二聚体,是非特异性扩增带
4楼2014-09-04 11:28:04
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lmc2537

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-09-04 11:28:04
不是引物二聚体,是非特异性扩增带

那为什么我跑胶没看到非特异条带啊,只有最下方100bp以下的引物二聚体,且空白对照也有一个孔有峰。
5楼2014-09-04 14:48:54
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