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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助DNA弥散状什么原因
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huakaihuaxie

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助DNA弥散状什么原因

CTAB提取的植物DNA，用的研磨仪破碎，检测的OD值260/280基本在2.01，260/230大于2，浓度为110ng左右，但是跑1%的胶检测就如图，请大家帮忙分析一下原因
求助DNA弥散状什么原因
eric 2013-08-06 11hr 42min.jpg
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1楼 2013-08-06 12:33:32
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huakaihuaxie: 金币+2 2013-08-08 22:56:37
是新鲜组织么? 好像是DNA降解了。
但是我没用过研磨仪，不知道这一步骤会不会造成gDNA的片段化呢？
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2楼2013-08-06 15:20:56
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hyphen007

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
应该从模板、引物、扩增体系等方面找原因；例如模板不纯、引物特异性不高、酶量过大、Mg++过高、退火温度低、dNTP过多等等
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3楼2013-08-06 16:44:02
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huakaihuaxie

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-08-06 15:20:56
是新鲜组织么? 好像是DNA降解了。
但是我没用过研磨仪，不知道这一步骤会不会造成gDNA的片段化呢？

不是新鲜材料，是去年采集的，但是用硅胶干燥而且在-80的冰箱中保存了的。今天用试管中研磨看看行不行
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4楼2013-08-06 18:24:58
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huakaihuaxie

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hyphen007 at 2013-08-06 16:44:02
应该从模板、引物、扩增体系等方面找原因；例如模板不纯、引物特异性不高、酶量过大、Mg++过高、退火温度低、dNTP过多等等

没有PCR，只是单纯的DNA检测
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5楼2013-08-06 18:26:42
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

那就应该是DNA降解了
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6楼2013-08-07 20:34:59
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Sthunder

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huakaihuaxie: 金币+2, ★有帮助 2013-08-08 22:56:22
LZ确定加了RNA酶处理吗？有可能是讲解的RNA，而你的gDNA含量很低
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互助互励，共奋共进！！
7楼2013-08-07 21:56:33
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cookee1981

银虫 (初入文坛)
DNA浓度太低了
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8楼2013-08-08 10:45:47
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huakaihuaxie

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Sthunder at 2013-08-07 21:56:33
LZ确定加了RNA酶处理吗？有可能是讲解的RNA，而你的gDNA含量很低

没有加RNA，今天PCR了一下，P出来了，所以跑不出来就算了
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9楼2013-08-08 22:57:22
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huakaihuaxie

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by cookee1981 at 2013-08-08 10:45:47
DNA浓度太低了

OD值检测浓度不低的
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10楼2013-08-08 22:58:30
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