24小时热门版块排行榜    

查看: 2312  |  回复: 12

xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】RT-PCR总是得不到目的条带 已有9人参与

我做RT-PCR已经很久了,最近电泳检测一直是呈弥散状,始终无法得到目的条带。RNA的提取个人认为已经是可以的了,三条带明显可见,略微有些拖带。然后按照TAKARA反转录试剂盒进行操作,内参条带很好,目的条带没有。

对反转录条件做调整后,在100-300bp处隐约可见条带,但我的条带(约900bp)处没有任何东西。我觉得是引物的可能性非常大,不过换了很多次的引物,结果还是一样。

希望得到大家的帮忙,解决这个让我心碎的问题,谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shengwufenzi

金虫 (正式写手)

你是做的植物的吗?如果是的话,你应该考虑一下基因表达的时间性。有可能你现在选择的时间不是时候啊。
2楼2010-04-23 22:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

RT-PCR总是得不到目的条带

我做得是动物组织的,也存在这个问题吗?
3楼2010-04-24 16:54:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
scelab(金币+3):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-04-26 17:08
引用回帖:
Originally posted by xuejinyz1 at 2010-04-24 16:54:03:
我做得是动物组织的,也存在这个问题吗?

动物组织当然也是存在这个问题的,不但要注意时间还要注意空间,就是说你的取样时间该基因可能不表达,你取的位置不对,可能也没有该基因的表达。这就是说,具体要看你做的是什么基因,在什么时候该基因表达,在什么组织中表达

按你说的情况,换了很多引物都效果不好,说明最大的可能就是跟基因丰度有关系
另外想知道楼主设计引物的模板,是就是该物种的该基因序列呢,还是近缘种设计的同源引物
4楼2010-04-24 19:29:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

RT-PCR总是得不到目的条带

就是该物种的基因序列
5楼2010-04-26 14:55:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★
plantaqp(金币+2): 2010-05-01 01:38
引用回帖:
Originally posted by xuejinyz1 at 2010-04-26 14:55:55:
就是该物种的基因序列

这么说,估计就是基因丰度太低的原因,还是考虑一下这种基因在什么情况下会表达,什么组织中表达的问题
6楼2010-04-28 13:10:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)

★ ★
plantaqp(金币+2): 2010-05-01 01:38
你是根据mRNA序列,cDNA序列还是基因组DNA序列设计引物的?注意内含子的影响
7楼2010-04-28 17:07:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amilie030312

金虫 (正式写手)

★ ★
plantaqp(金币+2): 2010-05-01 01:38
引物不对的可能性最大,如果确认引物没问题那退火温度是否合适,不出条带的影响因素很多的。
8楼2010-04-28 17:18:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuejinyz1

铜虫 (初入文坛)

目的基因在mRNA中的位置

我就按照genbank上mRNA基因序列来设计的引物,提供序列中的内含子已经去除了,所以不会影响的
9楼2010-04-30 10:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hubei989

木虫 (正式写手)

酵父菌


plantaqp(金币+1): 2010-05-01 01:38
xuejinyz1(金币+2): 2010-05-04 15:15:13
参考~估计是引物的问题额~
迷惑不解~
10楼2010-04-30 23:35:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xuejinyz1 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见