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流感病毒RT-PCR,电泳老是跑不出条带~~~纠结!
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suzz0901
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流感病毒RT-PCR,电泳老是跑不出条带~~~纠结!
从流感病毒感染的MDCK细胞中提取RNA,反转录cDNA后进行PCR扩增,跑电泳分析条带。目地序列为229bp.开始4月份条带很明显清晰,后来6月份重提时,怎么也出不来目的条带,不是非特异扩增就是弥散,改变了温度52,54,56,58,及酶等用量均无法出来目的条带。万分纠结,还望高人指点~~~
附图,第一张是原来4月较好结果,后面为最近电泳图(后面较清晰条带为GADPH)
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求助PCR老是跑不出条带
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【求助/交流】急!!!琼脂糖凝胶电泳的问题,跑不出条带了!!
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1楼
2011-08-31 10:54:45
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longlikun
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专业: 作物分子育种
【答案】应助回帖
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dhd997(金币+2): good 2011-08-31 12:03:36
suzz0901(金币+1): 谢谢,回复的好快!! 2011-08-31 15:00:31
最可能的是提取的RNA质量的问题,也有可能是反转录效率的2次有较大差别。最好用上次的cDNA做,如果需重新提取,请注意RNA提取的条件和试剂容器的处理。
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2楼
2011-08-31 12:02:39
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qinchunhong
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专业: 基础兽医学
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wanhscn(金币+2): 鼓励交流 2011-09-29 17:21:39
感觉你的第四块胶块好像都没有4月份的亮,会不会是EB或者Glodview的添加不对啊
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3楼
2011-09-29 12:53:55
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blackbee
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4楼
2011-09-30 10:54:32
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jocelyn2012
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虫号: 1776126
注册: 2012-04-24
专业: 生物化学
确定是同一批样品,不是变异的?话说我之前做RT也是这样,第一次很容易就P出来了,后来就一直不出结果。纠结几个月后发现第二批样品是诱变过的
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5楼
2012-04-29 14:53:46
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飞雪迷影
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注册: 2010-11-07
性别:
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专业: 兽医传染病学
提RNA时温度也是个问题,温度高也会使RNA自身发生降解,6月份比四月份室温高,这可能也是关键,楼主操作时一定要保证在冰盒上进行,保证低温
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6楼
2012-07-10 09:04:07
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