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【求助/交流】PCR后没有目的条带,有非特异性条带,求解决办法??
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核酸生物学实验经验 |
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wazlf(金币+1): 2011-02-27 15:28:55
dhd997(金币+2): 对了 2011-02-28 10:46:11
wazlf(金币+1): 2011-02-27 15:28:55
dhd997(金币+2): 对了 2011-02-28 10:46:11
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兄弟,以后有PCR的问题请在下面这个帖子里面问哈。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2897252&fpage=1 |
2楼2011-02-27 13:49:42
brightfuture01
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brightfuture01
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rainwander(金币+5): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-27 16:32:41
wazlf(金币+5): 谢谢你了! 2011-02-28 13:09:42
rainwander(金币+5): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-27 16:32:41
wazlf(金币+5): 谢谢你了! 2011-02-28 13:09:42
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呵呵,非特异的好一致呀,我还以为是引物二聚体呢。 你做真核线粒体的16S,这个我没有做过,不知道在不同物种之间的保守性有没 有细菌那么高。你引物来源的那篇文献和你做的是一个物种的么? 如果那个是非特异性扩增,那么亮的话,说明你的引物还是没有设计好,我看你 的退火温度才51度,可以再延长引物以提高退火温度。这个我觉得是最快速的方 法了。 另外不知道你设计的引物的理论Tm是多少,可不可以在51度的基础上再拉高几 度呢?比如到55、58的样子。 还有就是可以做一个touchdown PCR看看结果会不会有改善。 上面这两个可以先做,没提高的话就别优化什么了,重新设计引物。 |
7楼2011-02-27 15:55:16
★ ★
wazlf(金币+3): 2011-03-01 20:21:34
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-03-06 15:06:07
wazlf(金币+3): 2011-03-01 20:21:34
lstt09nk(金币+2): 感谢参与 2011-03-06 15:06:07
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那个我测过,不过是1.3KB左右的长度。 同意7楼的。。。我再帮忙整理下: (遇到这种情况一般先调整温度,再调整体系,再重新设计引物) 1、可以先用梯度PCR做不同退火温度。51确实低。可以每提高3度,一起做。 2、可以用TOUCHDOWN,理由是提高特异性 或者TOUCHUP,理由是你的模板质量差 3、增加模板用量,再另外加些MG2+,有条件的话可以加一些Q BUFFER或DMSO。。不过你才扩600多的,估计用不着,但是可以试试DMSO,便宜。 4、重新设计或合成引物 |
8楼2011-03-01 11:38:19
9楼2011-03-06 10:13:42
10楼2011-03-06 12:34:15
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,不好意思,楼主貌似是位MM,这个头像。。。。。。火影看多了。。