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武荷花S

新虫 (小有名气)

[求助] PCR无任何条带,完全是空白胶

我最近做PCR时,模板是基因组,电泳图除了Marker外,其他的一丁点条带都没有,完全是空白胶。我把所有体系全换新的,仍然没有,现在怀疑是引物问题,想验证下引物。打算用高浓度的琼脂胶(3%)来跑胶,能验证吗?





[ Last edited by 武荷花S on 2011-5-29 at 22:25 ]
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武荷花S

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by cellline at 2011-05-29 23:19:18:
楼主给的信息太少,不知你的模板是什么,我首先想到的是你的PCR模板质量如何?引物是参照什么去合成的还是借用别人的,

谢谢你的回复。模板就是基因组,上样量起初是20ng/25vl,后来模板进行稀释,做的梯度,结果一样。引物是根据已有的序列,自己设计的。
9楼2011-05-30 20:15:14
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cellline

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主给的信息太少,不知你的模板是什么,我首先想到的是你的PCR模板质量如何?引物是参照什么去合成的还是借用别人的,
2楼2011-05-29 23:19:18
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andy99990000

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, EPI+1): 很好 2011-05-30 08:28:39
武荷花S(金币+3): 2011-05-30 20:04:08
楼主的图里有阴性对照吗?如果已包括的话,可以排除PCR体系污染的可能,那么很明显你的PCR没有正常工作,可能的原因很多,以个人经验,楼主可以尝试以下几个检测方法:

1. 用实验室一定工作的引物扩增你的DNA,这样能够看出除你的引物以外其他试剂是否工作正常。
2. 确定是引物的问题后还有2种可能:
(1)你的PCR条件不适。按你的图来看,完全没工作,可以试试降低退火温度,做touchdown,或者增加Mg离子浓度及循环次数等。
(2)如果以上全试过还是不工作,那么很大程度上就是你的引物设计或者合成的问题了。解决方法就是重新设计或者合成,呵呵,废话了。

个人经验,希望有所帮助~~
3楼2011-05-30 00:23:51
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eydalhm

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): 鼓励交流 2011-05-30 08:28:57
我认为可能原因有:1.PCR引物问题,那就要换引物·~这个我还没碰见过。
                  2.PCR所用模板DNA浓度低了或者扩增效率不够,这种情况下,你适量增加几个(3-5)循环可能就有条带了·~有时候扩增效率低的话就会这样·~
飞跃寄托梦想
4楼2011-05-30 01:42:39
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