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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

[交流] 【求助/交流】(5.20更新)PCR产物电泳没有条带,why?已有10人参与

今天偶做了一个pcr,目的片段1800多bp,退火温度63,延伸2Min,不料做完之后电泳没有条带!不知道是何原因?

ps:100微升体系,10 buffer 5 DMSO  75 ddH2O dNTP 引物 模板 酶 都是2 没有加氯化钾,因为近来实验室都说加了氯化钾做不出来!

请高手帮忙分析原因?
还有我明天想做一个梯度,不知道设几个梯度好?还有如果做梯度的话,每一管做多少微升合适?

谢谢高手了!

5.20更新今天中午又去做了一个pcr,这次我做的是10微升体系的,分别用两种酶(鼎国的和pfu酶)各做了五个梯度,54 56 58 60 62度,结果下午去跑电泳还是没有任何条带,我考虑到是不是引物没有稀释均匀的问题,随后又对我的引物进行了电泳,点了5微升,有条带很亮!

目前已经可以排除引物的问题(因为我引物设计完成后让师姐都检查了一下,而且今天也排除了引物稀释均匀的问题);
现在我也不知道到底是什么问题了?大家有什么更好的建议没有?
有哪位仁兄用过pcr增强剂?

[ Last edited by 天使托 on 2010-5-20 at 18:45 ]
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scelab

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小木虫之有关部门负责人


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5 DMSO   氯化钾

我从来没加过这东西啊

是不是buffer里有的啊

多做几次吧
小木虫之有关部门负责人
2楼2010-05-18 22:31:10
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天使托

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T.Shen

引用回帖:
Originally posted by scelab at 2010-05-18 22:31:10:
5 DMSO   氯化钾

我从来没加过这东西啊

是不是buffer里有的啊

多做几次吧

楼上的你们做pcr都加什么?
我们实验室其实原来都不用加什么氯化钾,等等,只需要加增强剂就可以了~原来很好做,最近大家的pcr都不太理想!
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3楼2010-05-18 22:34:57
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scelab

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dNTP
Mg
buffer
ddH2O
primer
taq E

就这几样
扩的好好的
小木虫之有关部门负责人
4楼2010-05-18 22:36:47
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天使托

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T.Shen

引用回帖:
Originally posted by scelab at 2010-05-18 22:36:47:
dNTP
Mg
buffer
ddH2O
primer
taq E

就这几样
扩的好好的

其实taq E应该里面就含有氯化钾和DMSO等等的~
我们实验室原来有过一段时间只需要以下东西
primer
template
ddH2O
rtaq

你做过梯度没有?像我这种情况,一般如果要做梯度的话多少体系为好,我就是一个引物想扩增出来而已!
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5楼2010-05-18 22:42:45
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scelab

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引用回帖:
Originally posted by 天使托 at 2010-05-18 22:42:45:

其实taq E应该里面就含有氯化钾和DMSO等等的~
我们实验室原来有过一段时间只需要以下东西
primer
template
ddH2O
rtaq

你做过梯度没有?像我这种情况,一般如果要做梯度的话多少体系为好,我就是一个引 ...

如果你只是想看看能否扩出来,25,或者50的体系就可以了。
退火温度,最好能做几个。我没用过温度梯度pcr仪,因为实验室没有
但是我一般都能扩出来,只要基因是存在的~
当然如果是不确定基因有没有,那就得多试几次了~
小木虫之有关部门负责人
6楼2010-05-18 22:48:53
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天使托

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T.Shen

引用回帖:
Originally posted by scelab at 2010-05-18 22:48:53:

如果你只是想看看能否扩出来,25,或者50的体系就可以了。
退火温度,最好能做几个。我没用过温度梯度pcr仪,因为实验室没有
但是我一般都能扩出来,只要基因是存在的~
当然如果是不确定基因有没有,那 ...

我是想扩增出来之后继续往下做呢~!你看得多大体系~ 做个温度梯度是可以用一般PCR仪器设定的~谢谢你了!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
7楼2010-05-18 22:54:36
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pan琳lin

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我还不知道这个,过几天就来帮你分析分析,抱歉啊!呵呵
cptbtptp,bcptdtptp (吃葡萄不吐葡萄皮,不吃葡萄倒吐葡萄皮)
8楼2010-05-18 23:02:12
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gene001

金虫 (正式写手)

就是个普通教师

一般条件筛选试验用个20/25微升体系就可以了,可以省试剂的!梯度做个5-10个都可以的!
大家共同交流、共同提高!!!
9楼2010-05-18 23:05:46
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scelab

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Originally posted by 天使托 at 2010-05-18 22:54:36:


我是想扩增出来之后继续往下做呢~!你看得多大体系~ 做个温度梯度是可以用一般PCR仪器设定的~谢谢你了!

50就足够啦,根本用不了的

一般pcr仪?
怎么弄?
请教
小木虫之有关部门负责人
10楼2010-05-18 23:44:22
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