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Gromacs/Amber/NAMD
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英文综述是否需要润色及查重
vmyyds999
2026-01-25
刚刚
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DS/Syby
]
[已完结]
从RCSB上下载的TTR文件打开是二聚体
(评阅+1)
(1/1101)
greyhuli
2013-11-02
2013-11-03 10:36:09
by
126406380
[
MS
]
[已完结]
关于MS分子模拟中的真空层
(7/4293)
wangzhikun
2011-09-23
2013-11-02 19:44:18
by
843172290
[
其他
]
[已完结]
请问我想做甲烷到丁烷在纳米孔道内扩散方面的研究,用什么软件好呢?
(2/369)
yuandanuc
2013-11-01
2013-11-01 14:39:36
by
jiaoyixiong
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于lammps 质心速度vcm()如何输出问题
(2/2166)
奈落之夜
2013-10-31
2013-11-01 09:11:14
by
奈落之夜
[
LAMMPS/
]
[已完结]
data文件的问题
(6/1364)
xinmaoqin
2012-10-23
2013-11-01 08:56:37
by
天道and酬勤
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于VMD可视化的问题
(5/3079)
smm0528
2012-05-04
2013-10-31 19:43:18
by
天道and酬勤
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS 2.5.0 操作问题
(4/1305)
monsoncupid
2013-10-30
2013-10-31 19:13:38
by
monsoncupid
[
Gromacs
]
分子力场中非键能
(4/1498)
linyusuc
2013-10-30
2013-10-31 18:01:49
by
linyusuc
[
MS
]
[已完结]
我想配置一台服务器做高分子共混模拟,体系1000个原子左右,求建议,谢谢
(
1
2
)
(12/1518)
361844587
2013-10-28
2013-10-31 17:55:16
by
361844587
[
MS
]
[已完结]
耗散粒子动力学中珠子体积大小的不同
(5/3185)
liulinlinyan
2012-01-14
2013-10-31 17:15:31
by
darling1228
[
其他
]
【求助】用chemoffice画出小分子之后的优化问题
(7/2363)
michaelpao
2010-12-08
2013-10-31 13:39:02
by
微笑微微
[
DS/Syby
]
[已完结]
用DS 2.5对多亚基酶进行同源建模
(3/1178)
dingding9631
2013-10-28
2013-10-31 10:56:52
by
dingding9631
[
专家会诊
]
[已完结]
关于Reax的使用
(评阅+1)
(0/507)
宋云鹏苏苏
2013-10-30
2013-10-30 21:46:02
by
宋云鹏苏苏
[
DS/Syby
]
[已完结]
重对接问题
(7/768)
xiaodaolai
2013-10-30
2013-10-30 21:29:33
by
monsoncupid
[
LAMMPS/
]
[已完结]
reax里的例子不能算,提示无效的力场
(2/772)
宋云鹏苏苏
2013-10-29
2013-10-30 21:01:33
by
宋云鹏苏苏
[
Gromacs
]
[已完结]
模拟建立一个二元混合气体(CO2和H2)的盒子,怎么得到混合气体的密度?
(2/462)
巴雅尔
2013-10-29
2013-10-30 20:58:18
by
巴雅尔
[
其他
]
[已完结]
schrodinger中utilities的问题
(评阅+1)
(0/288)
xxwn
2013-10-30
2013-10-30 20:39:13
by
xxwn
[
MS
]
[已完结]
有关做Pd表面吸附CO的例子中对称性问题
(1/307)
jingjing1023
2013-10-30
2013-10-30 20:21:40
by
jingjing1023
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps里,关于应力应变的问题
(0/4984)
honghaier90
2013-10-30
2013-10-30 15:42:36
by
honghaier90
[
LAMMPS/
]
[已完结]
纳米金属Lammps 分子动力学研究课题组
(0/507)
hwceng0816
2013-10-30
2013-10-30 14:16:52
by
hwceng0816
[
MS
]
[已完结]
DS2.5操作
(2/480)
张学升
2013-10-21
2013-10-30 13:20:27
by
monsoncupid
[
其他
]
[已完结]
window xp 中,为什么分子模拟产生的文件大于4G,文件就会被覆盖(硬盘已是NTFS)
(评阅+1)
(2/390)
学员94tPwG
2013-10-29
2013-10-30 12:33:19
by
q1036210267
[
MS
]
[已完结]
各位虫友,有没有人有正版的MS
(0/259)
yjsharon
2013-10-30
2013-10-30 09:56:16
by
yjsharon
分子模拟——陈正隆教授 《分子模拟的理论与实践》
(17/2732)
fishrose
2012-02-22
2013-10-30 04:15:58
by
sr119
[
其他
]
[已完结]
samoa软件用法
(0/199)
veron
2013-10-29
2013-10-29 23:11:56
by
veron
[
其他
]
[已完结]
C++变形超级晶胞代码
(2/415)
喔喔wowo
2013-10-29
2013-10-29 22:20:47
by
喔喔wowo
[
Gromacs
]
恒定磁场对蛋白质的结构的影响
(3/652)
dxia85
2013-10-14
2013-10-29 21:12:36
by
biorad
[
DS/Syby
]
[已完结]
20金币求DS分子对接视屏教程
(8/2002)
lizzie_su
2011-08-30
2013-10-29 17:44:02
by
1574441329
[
MS
]
[已完结]
请问高手MS能做特定纳米结构的声子谱吗?比如纳米线
(0/270)
truewz
2013-10-29
2013-10-29 16:26:49
by
truewz
[
MS
]
[已完结]
怎样对于碳管表面添加一个锂原子,并对其进行结构优化
(评阅+1)
(0/220)
白玉浴血
2013-10-29
2013-10-29 15:38:23
by
白玉浴血
[
Monte C
]
[已完结]
求助大家两篇有关蒙卡的文献,不甚感激
(0/237)
qinjianfa
2013-10-29
2013-10-29 15:29:06
by
qinjianfa
[
Gromacs
]
[已完结]
急求解答,关于力场的电荷参数!!!
(4/2028)
haoguoyu
2013-10-27
2013-10-29 14:50:13
by
ChemiAndy
[
Monte C
]
[已完结]
sorption模块 fugacity和pressure??
(2/521)
linbin1990
2013-10-28
2013-10-29 11:11:39
by
原来是梦8804
[
MS
]
[已完结]
MS 密度曲线
(4/1839)
tim562944200
2013-10-21
2013-10-29 10:06:07
by
tim562944200
[
Gromacs
]
[已完结]
有没有研究淀粉方面分子动力学的大牛啊、本人菜鸟太多问题、需要帮助啊!!!
(
1
2
)
(11/1726)
三木713
2013-10-24
2013-10-29 09:29:58
by
阿德
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs中金属离子的处理
(6/2730)
qingtian510
2013-09-23
2013-10-29 09:05:47
by
泊小夏
[
Gromacs
]
[已完结]
使用amber中的antechamber 出现1 is not a valid atom id in CONECT
(0/246)
达夫
2013-10-28
2013-10-28 21:59:55
by
达夫
[
资源
]
[已完结]
急求文献一篇。非常感谢。
(1/420)
gliu5
2013-10-27
2013-10-27 23:09:56
by
fangsteel
[
Monte C
]
[已完结]
simbad/simspud 溅射模拟
(评阅+1)
(0/420)
ssjjleo
2013-10-27
2013-10-27 20:45:57
by
ssjjleo
[
Gromacs
]
[已完结]
蛋白质的电荷不为整数问题
(3/1856)
邓芳
2013-10-25
2013-10-27 16:27:43
by
fangsteel
[
CPMD/CP
]
[已完结]
关于cp2K软件的使用
(0/5000)
weinazh
2013-10-27
2013-10-27 16:12:06
by
weinazh
[
Gromacs
]
[已完结]
contact angle time line 接触角与时间的关系
(1/443)
jackwangee
2013-10-25
2013-10-26 15:16:05
by
王苗kevin
[
Gromacs
]
[已完结]
跑出盒子的原子怎么移回来
(3/1572)
shabeir
2013-10-25
2013-10-26 10:15:59
by
fhh2626
[
Gromacs
]
[已完结]
水溶菌酶模拟
(2/365)
水儿CoCo
2013-10-26
2013-10-26 09:46:10
by
水儿CoCo
[
MS
]
[已完结]
新手如何学习计算化学与分子模拟
(1/719)
城中木
2013-10-25
2013-10-25 20:48:46
by
youyno
[
Gromacs
]
[已完结]
求助VMD里面水的表示。。或者存储rst7的格式。。。
(4/956)
亍寞
2013-10-25
2013-10-25 15:00:16
by
亍寞
[
MS
]
[已完结]
ms画图求助,急急急
(1/393)
韩欢欢
2013-10-25
2013-10-25 14:18:00
by
pigrass
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求助:lammps怎么输出每一步的能量?
(2/3399)
暖雨
2013-10-22
2013-10-24 11:26:41
by
botar
[
DS/Syby
]
[已完结]
AutoDock大分子问题
(
1
2
)
(11/2297)
625915317
2013-10-18
2013-10-24 10:56:16
by
sjputao
[
Monte C
]
[已完结]
大家谁有这篇英文文献,我们学校的资源搜不到,谢谢了
(6/1218)
qinjianfa
2013-10-21
2013-10-24 10:13:56
by
孤独中生存
[
LAMMPS/
]
[已完结]
c++小白求助
(3/507)
韩欢欢
2013-10-20
2013-10-24 07:33:24
by
lsloneil
[
DS/Syby
]
[已完结]
怎样以Ref RMS来评价autodock对接方法的可靠性(重对接法)
(2/3308)
szhshuan
2013-10-22
2013-10-23 19:24:10
by
monsoncupid
[
Gromacs
]
关于gromacs的安装的问题
(2/510)
phyzhsh
2013-10-23
2013-10-23 17:10:19
by
phyzhsh
[
MS
]
[已完结]
水分子模型的设置问题
(0/469)
magaohong
2013-10-23
2013-10-23 16:59:41
by
magaohong
[
Gromacs
]
[已完结]
跑动力学时停电,就跑了一大半,能不能在继续做啊
(
1
2
)
(15/2189)
1054950560
2013-10-22
2013-10-23 16:46:03
by
1054950560
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS分子对接怎么评价?
(3/1809)
天湖酒
2013-09-11
2013-10-23 15:51:36
by
monsoncupid
[
MS
]
一个重大疑惑求解答
(6/928)
ck3369
2013-10-18
2013-10-23 15:26:14
by
ck3369
[
ME/Gulp
]
[已完结]
ME对同一个模型,每次的relaxation操作都引起结果的变化,为什么?
(1/444)
0712002160
2013-05-27
2013-10-23 06:21:11
by
王心凌wf
[
DS/Syby
]
[已完结]
我在sybyl里导入活性数据的时候,总有问号错误出现
(0/323)
565034654
2013-10-22
2013-10-22 17:31:38
by
565034654
[
MS
]
[已完结]
谁能帮我画一个钕铁硼(Nd2Fe14B)晶体单胞结构图啊?谢谢
(1/1855)
ccmm2008
2013-10-21
2013-10-22 16:52:57
by
pigrass
[
MS
]
[已完结]
ms 6.1安装求助
(2/487)
chenfeng2007
2013-10-22
2013-10-22 16:40:32
by
chenfeng2007
[
Monte C
]
[已完结]
初用MUSIC,请问分子文件从哪里能找得到?例如MIL-53
(
1
2
)
(10/1347)
rdfce6
2013-08-01
2013-10-22 11:43:17
by
m11111222222
[
MS
]
[已完结]
DS2.5问题求助
(4/1524)
张学升
2013-10-10
2013-10-22 09:54:07
by
yaozhq
[
MS
]
[已完结]
sorption模块中,逸度和压力有什么区别
(2/961)
linbin1990
2013-10-20
2013-10-22 08:36:06
by
linbin1990
[
Monte C
]
【求助】用monte carlo法做分子模拟,用什么编程语言实现比较好?
(25/4348)
yangbob
2011-01-15
2013-10-21 22:11:05
by
fucunfc
[
Gromacs
]
[已完结]
amber跑动力学后如何分析二级结构的变化
(0/672)
1054950560
2013-10-21
2013-10-21 15:43:25
by
1054950560
[
Monte C
]
[已完结]
蒙特卡罗法模拟玻璃固化体的浸出率
(0/498)
qinjianfa
2013-10-21
2013-10-21 14:28:55
by
qinjianfa
[
MS
]
[已完结]
MS软件运行过程中,计算机断电,重新开机后可否继续运行?如何操作?
(4/1169)
dsdragon0546
2013-10-19
2013-10-21 09:06:49
by
dragon_d
[
MS
]
[已完结]
MIL68上手动添加了H原子,然后用forcite优化
(1/501)
linbin1990
2013-10-20
2013-10-20 22:53:16
by
Voland
[
Gromacs
]
我想用gromacs做部分水解聚丙烯酰胺水溶液的分子动力学模拟
(0/349)
qugm110
2013-10-20
2013-10-20 17:16:45
by
qugm110
[
DS/Syby
]
[已完结]
有离子的化合物如何对接
(0/456)
zhouzhiguang
2013-10-19
2013-10-19 20:56:23
by
zhouzhiguang
[
专家会诊
]
[已完结]
[关贴]
lammps跨节点安装合适吗?
(7/2067)
1612
2013-10-17
2013-10-19 20:20:37
by
1612
[
MS
]
[已完结]
水分子的模拟
(2/678)
magaohong
2013-10-17
2013-10-19 19:59:51
by
dsdragon0546
[
Gromacs
]
[已完结]
[关贴]
SiO2的模型-gromacs
(0/1210)
polyester
2013-10-19
2013-10-19 16:03:10
by
polyester
[
MS
]
[已完结]
请问这样的结构图用什么软件画
(2/938)
honeyduck
2013-10-18
2013-10-18 23:19:43
by
honeyduck
[
专家会诊
]
有没有可以模拟合金团簇结构的软件?
(0/360)
hakuna
2013-10-18
2013-10-18 19:12:17
by
hakuna
[
其他
]
[已完结]
催化反应,其中一个反应物添加多会造成反应速率降低是什么原因
(2/434)
mln2007
2013-10-15
2013-10-18 17:42:56
by
mln2007
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps 如何让原子以某种速度(函数)移动?
(0/3138)
树栽子047
2013-10-18
2013-10-18 16:33:05
by
树栽子047
[
其他
]
[已完结]
autodock 模拟结果不对
(5/778)
huantao12
2013-10-10
2013-10-18 16:10:01
by
药物设计
[
专家会诊
]
【求助】VASP做频率计算算出的虚频都上2000+cm-1了,请教是不方法错误。
(1/709)
惜小君
2013-08-15
2013-10-18 16:08:59
by
hakuna
[
ME/Gulp
]
[已完结]
.xtd和.xcd文件的问题
(4/1709)
sd-wmg
2013-10-17
2013-10-18 15:30:15
by
pigrass
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MS
]
大神看看怎么用gaussview画出来?谢谢了
(2/2413)
小范范1989
2013-10-17
2013-10-18 12:48:39
by
tsingtaobeer
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MS
]
[已完结]
金属团簇沉积过程模拟可以用MS实现吗?
(5/917)
walkhf
2013-10-11
2013-10-18 11:39:13
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voleyes
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资源
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[已完结]
求amber9.tgz
(2/441)
euroford
2013-10-15
2013-10-18 10:22:33
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euroford
[
Gromacs
]
[已完结]
GROMACS做二维多孔石墨烯的MD,求一合适的nvt.mdp参数文件
(1/1095)
Physics77
2013-10-16
2013-10-17 21:38:31
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fangsteel
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专家会诊
]
[已完结]
做虚拟筛选判断一个化合物好坏的标准是什么
(6/1750)
piscesee
2013-10-14
2013-10-17 18:25:04
by
huyingdamon
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DS/Syby
]
[已完结]
AutoDock安装问题
(5/1356)
xiaodaolai
2013-10-13
2013-10-17 12:44:31
by
xiaodaolai
[
MS
]
[已完结]
构建晶体结构,这其中P是什么意思啊
(0/1078)
Lzp425496024
2013-10-17
2013-10-17 10:12:53
by
Lzp425496024
[
MS
]
[已完结]
用以描述碳硫和碳氧的势函数
(0/343)
songyunsu
2013-10-17
2013-10-17 09:13:19
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songyunsu
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LAMMPS/
]
[已完结]
Ubuntu 编译Lammps 单机串行错误,帮帮忙
(评阅+1)
(5/2136)
shixha
2011-04-23
2013-10-17 07:24:19
by
aihehaitang
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DS/Syby
]
【求助】DS2.5操作问题
(4/1124)
sungl07
2010-07-27
2013-10-16 21:23:58
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wmj89729
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Gromacs
]
[已完结]
Gromacs跑完动力学模拟之后如何分析小分子和蛋白之间的相互作用?
(2/1252)
pkuchemistry
2013-10-15
2013-10-16 20:28:18
by
转基因猴子
[
Gromacs
]
[已完结]
跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容,为什么?
(4/1933)
pkuchemistry
2013-10-16
2013-10-16 19:03:25
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pkuchemistry
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LAMMPS/
]
[已完结]
能够使用LJ势来模拟水吗
(4/934)
chenjingzhi
2013-10-14
2013-10-16 14:24:43
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chenjingzhi
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其他
]
[已完结]
PyRx中怎样添加Si的原子类型
(0/386)
邓芳
2013-10-16
2013-10-16 11:36:23
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邓芳
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DS/Syby
]
[已完结]
我是初学小菜鸟, 请教版内高手有什么杂志常收录相关docking的文件,比较权威的
(2/444)
junjun0711
2013-10-15
2013-10-16 11:07:30
by
junjun0711
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LAMMPS/
]
[已完结]
除了写restart,lammps里还有其他方法保留group信息,以便继续计算吗?
(0/937)
rush7
2013-10-16
2013-10-16 03:30:41
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rush7
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MS
]
[已完结]
关于结构优化的问题
(0/898)
白发魔女
2013-10-15
2013-10-15 20:03:33
by
白发魔女
[
MS
]
[已完结]
MS无法导出任何格式的文件
(4/2342)
rdfce6
2013-08-15
2013-10-15 17:51:26
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奈落之夜
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