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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用DS 2.5对多亚基酶进行同源建模
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dingding9631

金虫 (小有名气)

[求助] 用DS 2.5对多亚基酶进行同源建模

模板为六亚基蛋白，每个亚基的序列和结构都相同。我现在只能建出单亚基模型，有人说可以接着做分子叠合。请教各位高手，具体应该怎么做？万分感激！
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1楼 2013-10-28 22:07:29
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-10-30 13:33:43
dingding9631: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-10-31 10:56:32
手动调出模板全部序列 再把你的序列和它对齐 单亚基对齐方式可以用ds的模块去做 但是多亚基的有时候算的不好 直接手动去复制6遍填进去就好了 然后在这个基础上做建模就行了
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2楼2013-10-30 09:50:36
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monsoncupid

金虫 (小有名气)
手动复制的话相对坐标怎么确定啊？
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宅若久时天然呆，呆到深处自然萌
3楼2013-10-30 12:56:47
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dingding9631

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2013-10-30 09:50:36
手动调出模板全部序列 再把你的序列和它对齐 单亚基对齐方式可以用ds的模块去做 但是多亚基的有时候算的不好 直接手动去复制6遍填进去就好了 然后在这个基础上做建模就行了

谢谢，正在尝试。
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4楼2013-10-31 10:56:52
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