应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 【求助】用monte carlo法做分子模拟，用什么编程语言实现比较好？
261/1返回列表
查看: 4495  |  回复: 25
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yangbob

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用monte carlo法做分子模拟，用什么编程语言实现比较好？

用monte carlo法做分子模拟，用什么编程语言实现比较好？需要做出分子运动轨迹的图形（团簇结构），还有RDF曲线。
本人是初学者。请各位高手说得详细些，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-01-15 16:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghcacj

荣誉版主 (著名写手)
★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-01-16 20:56:05
MC算法能实现分子运动轨迹？RDF曲线？你说的应该是MD方法吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-01-15 17:08:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangbob

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2011-01-15 17:08:54:
MC算法能实现分子运动轨迹？RDF曲线？你说的应该是MD方法吧

MC不能实现分子运动轨迹么？
MC肯定能反映分子结构，
赞一下 回复此楼
3楼2011-01-15 18:19:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
yangbob(金币+1): 2011-01-15 22:39:37
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-01-16 20:55:57
yangbob(金币+1): 谢谢回复 2011-01-18 09:27:20
引用回帖:
Originally posted by yangbob at 2011-01-15 16:43:30:
用monte carlo法做分子模拟，用什么编程语言实现比较好？需要做出分子运动轨迹的图形（团簇结构），还有RDF曲线。
本人是初学者。请各位高手说得详细些，谢谢！

这要看你做的是什么monte carlo了，不过科学计算语言最好的还是FORTRAN.
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-01-15 18:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangbob

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-15 18:53:19:

这要看你做的是什么monte carlo了，不过科学计算语言最好的还是FORTRAN.

用matlab和fortran 比，优点和缺点能说一点么？
赞一下 回复此楼
5楼2011-01-15 22:39:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0610240

木虫 (正式写手)
★ ★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-01-17 21:57:58
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-01-17 21:58:06
yangbob(金币+1): 谢谢回复 2011-01-18 09:27:05
yangbob(金币+1): 2011-01-19 22:31:19
引用回帖:
Originally posted by yangbob at 2011-01-15 22:39:30:


用matlab和fortran 比，优点和缺点能说一点么？

据说matlab 比 Fortran速度更快
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-01-17 12:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianggui7895

银虫 (小有名气)
★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-01-17 21:58:03
yangbob(金币+1): 谢谢回复 2011-01-18 09:26:53
matlab吧，容易上手。不过高手都用Fortran
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-01-17 19:20:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
yangbob(金币+1): 谢谢回复，希望继续交流！ 2011-01-18 09:26:42
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-01-19 16:39:04
我从fortran转到c++了。c++的速度可能稍慢于fortran，但语法灵活，对程序的改动与管理更为方便
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-01-18 01:42:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0610240

木虫 (正式写手)
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:29:32
请问MATLAB可以实现分子动力学模拟吗？
引用回帖:
Originally posted by xianggui7895 at 2011-01-17 19:20:38:
matlab吧，容易上手。不过高手都用Fortran

赞一下 回复此楼
9楼2011-01-18 18:32:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianggui7895

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-01-19 16:39:16
引用回帖:
Originally posted by 0610240 at 2011-01-18 18:32:09:
请问MATLAB可以实现分子动力学模拟吗？


why not? 而且会很方便

PS：我没编过，但是知道可以：）
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-01-19 10:54:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-01-23 15:43:11
好久没来了, 灌水一下.

你会啥语言, 就用什么语言.
赞一下(2人) 回复此楼
11楼2011-01-20 12:04:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0610240

木虫 (正式写手)
啥语言都不会的飘过
引用回帖:
Originally posted by qphll at 2011-01-20 12:04:15:
好久没来了, 灌水一下.

你会啥语言, 就用什么语言.

赞一下 回复此楼
12楼2011-01-21 12:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wl1777

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-02-05 20:52:54
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:29:54
只会Fortran的含泪飘过。MC算RDF应该没问题，也就是一个数个数的问题。

轨迹这个问题就比较复杂，不是很好解决，就算出来的结果可能和实际系统查得也挺大。

MC原则上说毕竟只是一个掷骰子的游戏。
赞一下(2人) 回复此楼
13楼2011-01-24 06:35:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-02-05 20:53:01
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:03
速度最快的肯定还是F啊，
赞一下(3人) 回复此楼
14楼2011-01-26 17:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangqingbo

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-02-05 20:53:07
推荐C＋＋，其实语言之争由来已久，不多综合考虑还是认为C＋＋好
赞一下(2人) 回复此楼
15楼2011-01-28 12:48:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1dubo

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-04 10:21:46
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:10
MATLAB使用起来，方便，学起来简单易懂，画图方便，但是对于计算来讲，计算大体系时，速度特慢
Fortran 语言环境跟MATLAB相似，但是程序出来时感觉比较乱，一般初学者学习应慎重，不过速度相当快，一般高手喜欢
C/C++个人认为是最好的，程序有条理，适合初学者学习，速度也比较快。
赞一下(1人) 回复此楼
16楼2011-03-03 21:27:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dubo

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-09 14:11:27
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-06-08 16:27:08
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:14
这个可以有，呵呵
matlab可以实现MC,算小体系较快，不过体系一大，速度特慢，比C和fortran慢多了
不过他的语言简单易学。
C，fortran比较适合做计算，一是速度好，二是可以移植好
赞一下(4人) 回复此楼
17楼2011-03-08 11:26:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alwin1

捐助贵宾 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-06-08 16:26:56
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:20
python/c++
http://code.google.com/p/gce-ising/
赞一下(2人) 回复此楼
18楼2011-06-08 14:38:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李学忠

铁杆木虫 (知名作家)
fortran
回复此楼
19楼2011-06-08 18:14:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-06-09 18:28:22
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:25
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2011-01-15 17:08:54:
MC算法能实现分子运动轨迹？RDF曲线？你说的应该是MD方法吧

这取决于体系的动力学特征。如果是随机的，那么MC完全可以。我以前在别的回帖中说过，例如高分子链在溶液中的动力学，你完全可以使用MC来研究。

至于楼主所问的编程语言，我推荐c++(几年前用的是fortran)。速度不比fortran慢什么，但是修改及管理比fortran更为灵活。
赞一下(3人) 回复此楼
20楼2011-06-09 00:10:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-06-09 18:28:04
yangbob(金币+1): 2011-06-10 08:30:32
引用回帖:
Originally posted by yangbob at 2011-01-15 16:43:30:
用monte carlo法做分子模拟，用什么编程语言实现比较好？需要做出分子运动轨迹的图形（团簇结构），还有RDF曲线。
本人是初学者。请各位高手说得详细些，谢谢！

Python可以。网上有现成的模板程序：

Dynamo

不要钱儿。 请自行google获取。
赞一下(2人) 回复此楼
21楼2011-06-09 12:06:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasonyang

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
yangbob(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-06-26 22:03:19
我从原来使用fortran77到现在的Fortran 95，我觉得Fortran在计算方面比C强，而且现在高级Fortran语言的模块化功能非常强大。我现在写的Fortran软件包基本上都采用模块格式。非常方便增减
赞一下(2人) 回复此楼
22楼2011-06-26 00:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

谷雨精致

金虫 (正式写手)
★
yangbob(金币+1): 谢谢参与
到底是用什么语言啊，对于一个初学者
赞一下 回复此楼
23楼2013-07-10 13:22:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qinjianfa

新虫 (小有名气)
★
yangbob(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
20楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-06-09 00:10:02
这取决于体系的动力学特征。如果是随机的，那么MC完全可以。我以前在别的回帖中说过，例如高分子链在溶液中的动力学，你完全可以使用MC来研究。

至于楼主所问的编程语言，我推荐c++(几年前用的是fortran)。速度 ...

朋友，可以交流一下MC嘛？在软件方面，求助
赞一下 回复此楼
24楼2013-10-21 15:18:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
内容已删除
回复此楼
25楼2013-10-22 01:11:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fucunfc

新虫 (初入文坛)
mc不能描述分子运动轨迹吧，rdf肯定没问题的。语言的话matlab就算了，用它会让别人低看你的。做科研的话fortran肯定是首选，大家都用。c++的话功能更加强大，做计算机程序肯定优于fortran，但是fortran做科研够用了。
赞一下 回复此楼
26楼2013-11-13 20:55:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yangbob 的主题更新
261/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +7 秋有木北 2026-03-14 7/350 2026-03-15 17:30 by 小物理化学
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 26考研调剂 +3 ying123. 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:18 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 抓着星星的女孩 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:47 by userper
[考研] 279求调剂 +3 Dizzy123@ 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:02 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭