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【讨论】大家对未来GPU在monte carlo中的应用持有什么样的态度(CUDA)？已有6人参与
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| 现在很多蒙特卡罗的开源代码不能并行，这是一个缺憾，导致很多时候，运行效率很低。 |
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yahoohoo
铁杆木虫 (著名写手)
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★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+5):谢谢 在点子上 2010-09-11 20:51:51
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+5):谢谢 在点子上 2010-09-11 20:51:51
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首先提醒一点，做科研千万不要想当然。 MD的并行和MC的并行完全是两码事。在MD中，每一步我们都需要更新力和位移。由于力的计算最为耗时，因此我们可以采用不同的手段，譬如 MPI或OpenMP 进行并行，将计算力的任务分配到多个CPU或核上。而MC的并行却不像MD这么直观。绝大多数的MC算法都是局域的，即local move，意思是MC运动只涉及体系中的部分原子位置的变化。因此MC最为有效的做法，也是大家一贯采用的做法，就是在MC运动前后计算涉及到的那一部分原子的能量变化。正因为MC运动的这种局域性，利用并行计算能量并不能有效地加速MC模拟。而且这种并行计算能量的做法也并不是真正意义上的Parallel MC。真正的Parallel MC是指我们可以平行选取体系中的几个局部，而这几个局部是彼此对立的，那么对每个部分就可以单独施行MC运动，而不至于相互影响。简单而言，Parallel MC就是可以同时改变体系的多个局部构象。很显然，这与Parallel MD完全不是一个概念。 [ Last edited by yahoohoo on 2010-9-11 at 19:37 ] |
6楼2010-09-11 19:35:24
2楼2010-09-11 10:57:31
材料类初学者可以看的书
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢您的介绍 2010-09-11 11:31:12
zh1987hs(金币+2):谢谢您的介绍 2010-09-11 11:31:12
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材料类初学者可以看的书除了《概率论》《蒙特卡罗方法引论》《蒙特卡罗方法》等MC基础书外，做材料（主要包括高分子材料，固体材料，薄膜材料）的同行们可以看一下《计算材料学》(德)D.罗伯(Dierk Raabe)编著，项金钟,吴兴惠译；《计算材料科学》陈舜麟编著；《分子模拟》(荷)Frenkel，Smit著，汪文川等译； 这些书既与MC方法有关，又与你所研究的方向有关，而且难度并不是特别大。除此之外就是要学习编程语言，现在主要用的是fortran,c,VB,这三种都有现成的源程序可以参考，尤其是fortran，专门作科学计算用，台湾人彭国伦写的《Fortran 95》就很不错，网上也有电子版，除此之外，还有徐士良的《Fortran算法程序集》。c语言我不太会用没有发言权。VB的好处就是可视化，操作也很方便，也有大量的应用。总之，材料是一个交叉学科，比较难，所以大家都不能急功近利，要耐得住寂寞，终有所成。上面所列举的书，本论坛应该都有电子版，大家可以查一查。以上是我自己的一家之言，不足之处请大家指正。 |
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neoxie3楼2010-09-11 11:26:06
4楼2010-09-11 13:59:51
5楼2010-09-11 14:19:13
7楼2010-09-11 21:10:15
dellus
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8楼2010-09-12 09:36:34
yalefield
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