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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 怎样计算SMILES描述符中用到的Monte Carlo优化算法？
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

[求助] 怎样计算SMILES描述符中用到的Monte Carlo优化算法？

SMILES描述符中用到Monte Carlo优化算法计算CW的值，哪问高手能将具体的计算过程共享一下，谢谢！
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坚持就是胜利
1楼 2012-03-23 10:27:31
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
胜马叫SMILES？
胜马叫SMILES描述符？
听硕过Monte Carlo......
胜马是CW？
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2楼2012-03-23 12:27:59
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
2楼: Originally posted by yalefield at 2012-03-23 12:27:59:
胜马叫SMILES？
胜马叫SMILES描述符？
听硕过Monte Carlo......
胜马是CW？

simplified molecular in put line entry system(SMILES)SMILES描述符就是建立QSAR模型时用到的一种方法。
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坚持就是胜利
3楼2012-03-23 14:15:41
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★
zhangguangping: 金币+2, 谢谢指导！ 2012-03-23 14:59:21
引用回帖:
3楼: Originally posted by 邓芳 at 2012-03-23 14:15:41:
simplified molecular in put line entry system(SMILES)SMILES描述符就是建立QSAR模型时用到的一种方法。

俺从SMILES出生那天起，就是看着它长大的。
它是记录分子结构的线性编码。
可是，啥叫SMILES描述符呢？
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4楼2012-03-23 14:56:29
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by yalefield at 2012-03-23 14:56:29:
俺从SMILES出生那天起，就是看着它长大的。
它是记录分子结构的线性编码。
可是，啥叫SMILES描述符呢？

The SMILES-based descriptors calculated with correlation weights of SMILES attributes which are obtained by the Monte Carlo method.
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坚持就是胜利
5楼2012-03-23 16:37:22
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
4楼: Originally posted by yalefield at 2012-03-23 14:56:29:
俺从SMILES出生那天起，就是看着它长大的。
它是记录分子结构的线性编码。
可是，啥叫SMILES描述符呢？

SMILES-based optimal descriptors were calculated as DCW =ΠCW（x）
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坚持就是胜利
6楼2012-03-23 16:43:09
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhangguangping: 金币+2, 谢谢推荐！ 2012-03-31 00:06:47
俺抽空看了看这个乌兹别克斯坦作者的几篇论文，好大一片汪洋啊。

原来，一切都是从2003年美国田纳西Schultz, T.W开始的：

Toropov, A.A., Schultz, T.W.
Prediction of aquatic toxicity: use of optimization of correlation weights of local graph invariants.
J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003. 43, 560–567

好好看看这篇吧。现在J. Chem. Inf. Comput. Sci.已经改名咯。
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7楼2012-03-25 11:51:32
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
7楼: Originally posted by yalefield at 2012-03-25 11:51:32:
俺抽空看了看这个乌兹别克斯坦作者的几篇论文，好大一片汪洋啊。

原来，一切都是从2003年美国田纳西Schultz, T.W开始的：

Toropov, A.A., Schultz, T.W.
Prediction of aquatic toxicity: use of optimiza ...

好的，谢谢了
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坚持就是胜利
8楼2012-03-26 11:53:18
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫
引用回帖:
7楼: Originally posted by yalefield at 2012-03-25 11:51:32:
俺抽空看了看这个乌兹别克斯坦作者的几篇论文，好大一片汪洋啊。

原来，一切都是从2003年美国田纳西Schultz, T.W开始的：

Toropov, A.A., Schultz, T.W.
Prediction of aquatic toxicity: use of optimiza ...

我看过这篇文献了，可是不知道怎样通过蒙特卡洛优化过程计算权重系数CW,请大师帮忙
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坚持就是胜利
9楼2012-03-30 14:25:40
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