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怎样以Ref RMS来评价autodock对接方法的可靠性（重对接法）
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我用从下载下来的蛋白质晶体复合物中抠出的小分子，用AUTODOCK向该蛋白质上进行重对接，来验证对接方法的好与坏，那么当对接结果中的Ref RMS值小于多少时，结果可以接受，我的对接结果中，此值一直在1.53左右，这个结果正常吗？ 另外，其中一个化合物A比另外一个化合物B的IC50值低，对酶的抑制力好（暂且认为两个化合物对同一受体的结合口袋基本相同，那么只有当A的对接结果中的binding energy 比B的低，才能说明对接结果正常吗？ |
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