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qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 菌液测序后,着么去NCBI比对 已有1人参与

通过感受态细胞连接后着么去NCBI去掉感受态细胞,拿到我自己的目的片段呢
AGTTGGAATGGCTCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATTATGAACTCTCTGAACCAGCAATACGAGGAGAAGGTTCGTCCCTGCATCGACCTGATCGACTCTCTCCGCTCTCTGGGTGTGGAGATGGACCTGGCGCTGCCGGCCATCGCCGTGATTGGGGACCAGAGCTCGGGGAAGAGCTCGGTGCTGGAGGCGCTGTCAGGGGTGGCGCTGCCCAGAGGGAGCGGCATTGTGACAAGATGTCCTCTGGAACTGAAGATGAAGAGAAAAAAAGAAGGGGAGGAATGGTATGGAAAGATAAGCTACCAGGACCGTGAGGAAGAAATAGATGACCCCACAACTGTGGAGAAAAAAATTCGAGAAGCTCAGGATGACATGGCTGGAGTTGGATTGGGGATCAGTGATGAGCTCATCAGTCTGGAAATTGCTTCCCCTGACGTTCCTGACCTGACACTCATCGACCTGCCTGGCATTGCCAGGGTGGCTGTGAAGGGCCAGCCAGAGAACATCGGAGATCAGATAAAGAGACTTATCCAAAAGTTCATTACAAAACAAGAAACAATCAGTTTGGTGGTGGTTCCAAGCAACGTGGACATAGCAACCACTGAGGCTTTGAAGATGGCTCAGCAGGTGGATCCGGAGGGAGAGAGGACACTGGGCATTTTAACCAAACCTGACCTGGTGGACAAAGGCACAGAAGAAACGGTGGTGGAAATAGCCCACAATGAGATCATCCAGCTAAAGAAAGGGCTACATGATCGTCAAGTGCATGGGTCAGATGGAGATTACAGAGAAAGGTGTCCCTAACTGAAGCTATAGAGCGAGAGAAGGCCTTCTTCCAAGATCACGCATATTTCCATACCCTCTACAATGATGGGCCATGCGACTGTTCCAAAGCTGGGCTGAAAAGCTCACTCTTGAACTGGTGCATCACATTGAGAAATCTTTGCCTCGACTGGAAGAACAGATAGAGGAAAAGCTAAAAACAGAACCTCAGAATGGAGCT
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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qaz139687(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励热心回帖交流 2014-11-26 10:14:05
你说的应该是PCR产物连到T载上转化感受态,筛选的阳性菌质粒测序吧?
1.可以去NCBI的vecscreen(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/vecscreen/)比对。
2.直接在测序结果中搜索你的上下游引物,引物之间的就是你的序列。
3.直接在测序结果中搜索插入位点两侧载体的序列,之间的部分就是你的序列。
2楼2014-11-25 15:26:58
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王冠傑

铁虫 (小有名气)

你的载体是什么?去掉载体序列不就得了?
3楼2014-11-25 21:20:15
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qaz139687

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 王冠傑 at 2014-11-25 21:20:15
你的载体是什么?去掉载体序列不就得了?

载体是PMD 18-T Vector ,用NCBI上那个去,只去掉45碱基,感觉有点少
4楼2014-11-26 10:39:10
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