24小时热门版块排行榜    

查看: 1933  |  回复: 6

殷筱婕

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR结果为目的条带,可是测序同源比对很差,这是为什么呀? 求助!!!

我拿山羊NCBI上登录的序列来设计引物,PCR后连接载体,菌液测序,结果再与原序列比对,同源性很差,表现为断断续续的。怀疑测的是载体的那一段,于是又直接测PCR产物,结果一样。为什么扩出来的片段没问题,测序是这种结果?请问是什么原因呢?有没什么可以解决的办法呢?谢谢,请各位大神帮帮忙!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
比对一下氨基酸看看

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2013-07-19 22:13:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyongliangx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
殷筱婕(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你的更多精彩。 2013-07-20 10:45:25
你换个测序公司 试试看呢,如果还是这样,那就可能是你扩增的不对或者序列本身就不对
3楼2013-07-19 22:13:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雅娣

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-07-31 22:42:03
我遇到过这样的情况,PCR条带很亮说明某个长度的DNA被扩出来了,但是比对的结果不好就说明提出来的DNA不是目的DNA,是其他东西。。也有可能是引物的问题,扩出来的不是目的基因。。
4楼2013-07-31 22:30:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxf427427

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

把引物拿去ncbi blast  看是否和其他片段也能结合 刚好扩出来同样大小片段
5楼2013-09-29 09:51:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

taccycle

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你应该在PCR之后就对PCR产物进行测序,如果是你的目的片段,你再做连接,如果不是你的目的序列,你要检查一下是不是引物特异性差还是说你的山羊品种和数据库中的不一样,你可以把你的引物在NCBI的Primer-BLAST 上balst一下,看看能不能扩增出你的目的片段
用心
6楼2013-10-16 15:37:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xfyangsibs

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

说明你扩增到的就不是目的条带啊,大小什么的不说明问题,测序一般不会出错,建议换引物。
7楼2013-10-17 09:46:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 殷筱婕 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +9 不知道叫什么! 2026-03-15 10/500 2026-03-16 10:04 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-15 7/350 2026-03-16 09:43 by 闲人终南山
[考研] 材料专硕306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:19 by Demonsssss
[考研] 321求调剂 +4 大米饭! 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:41 by Linda Hu
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕,一志愿中国矿业大学,总分314,求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-12 5/250 2026-03-13 10:56 by houyaoxu
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
信息提示
请填处理意见