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xwsooo

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】减少PCR错配

我在做PCR时,从电泳结果看貌似有与目的产物相同大小的片段出现,但是怀疑有的是由于错配形成的,经过提高退火温度,减少循环次数后,发现原有的有些片段消失了,可见有的是由于错配引起的假阳性,那么问题是我接下去该如何做才能减小错配发生呢?
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xwsooo(金币+1):谢谢参与
这个只有用高保真性的酶了,比如 Taqplus!
2楼2011-01-18 15:36:38
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★ ★ ★
xwsooo(金币+1):谢谢参与
rainwander(金币+2): 这2个保真酶很不错,强烈推荐~~~ 2011-01-18 21:15:08
xwsooo(金币+1): 2011-01-18 21:23:48
高保真的一般是pfu和kod,taqplus保真性很差,仅强于taq
3楼2011-01-18 15:41:36
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)



xwsooo(金币+1):谢谢参与
消失的片段也可能是你要的片段啊。
4楼2011-01-18 16:34:00
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翱宇

禁虫 (正式写手)


★ ★ ★
xwsooo(金币+1):谢谢参与
rainwander(金币+2): KOD的保真性很好,但是比较贵啊·~~ 2011-01-18 21:14:50
我习惯于用Kod-plus保真性很好,基本上没有错误的。但是有一点需要注意,你的PCR的引物有可能会错,合成的碱基数越多,越容易错。建议测序正确后,进行酶切和链接,而不要通过PCR进行亚克隆!
5楼2011-01-18 18:43:47
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xwsooo

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by skkyy88888 at 2011-01-18 16:34:00:
消失的片段也可能是你要的片段啊。

怎么可能。。。不解。。。
6楼2011-01-18 21:13:01
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xwsooo

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 翱宇 at 2011-01-18 18:43:47:
我习惯于用Kod-plus保真性很好,基本上没有错误的。但是有一点需要注意,你的PCR的引物有可能会错,合成的碱基数越多,越容易错。建议测序正确后,进行酶切和链接,而不要通过PCR进行亚克隆!

我的上游引物在18bp,下游引物22bp.我的目的序列并没有酶切位点,用的是等位基因PCR...
7楼2011-01-18 21:14:44
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
克隆基因片段我一直用PFU,貌似很贵,但是值得,测序不会出现错误。
省去了很多麻烦,建议初次做PCR还是摸一下条件(退火温度)
8楼2011-01-18 21:38:19
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xwsooo

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by zhangxn2010 at 2011-01-18 21:38:19:
克隆基因片段我一直用PFU,貌似很贵,但是值得,测序不会出现错误。
省去了很多麻烦,建议初次做PCR还是摸一下条件(退火温度)

谢谢,我的退火温度已经到了65了,貌似不能再升高了吧。。。
9楼2011-01-19 11:00:56
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guang012345

新虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
学长跟我说KOD和LA的还不错
10楼2011-01-19 17:06:56
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amilie030312

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
话说各种Taq都不是高保真酶
11楼2011-01-19 22:49:44
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傻子

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引物的特异性不够和taq酶是否保真没有关系,用hotstar taq可以减少非特异性扩增
12楼2011-01-20 14:27:16
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bigboy123

铜虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个吗,什么酶也不会完全保真的,减少突变的话,降低循环次数,缩短整个PCR过程的总时间,把PCR系统的扩增效率提高到最大,也就是这些东西。
13楼2011-01-20 14:48:03
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