版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

xu19850927

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1241.4
帖子: 259
在线: 96.4小时
虫号: 857892

[交流] 【求助】关于测序后序列对比的问题

我最近做的课题是扩增人的基因组DNA，然后测序，现在已经得到测序的结果，请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么？有人说用Blast，或者看峰图，有没有做过这方面的实验的解答一下，多谢

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

测序的序列比对问题！已经有4人回复
测序结果不好的序列能够做系统发育树吗？已经有7人回复
转录组测序的生物学重复问题已经有12人回复
高通量测序序列分析已经有18人回复
细菌16S测序诡异的现象已经有11人回复
基因组测序结果问题已经有7人回复
怎样获得反向序列已经有8人回复
ncbi序列比对结果显示灰色小写字母已经有9人回复
DGGE序列建系统发育树原序列和比对序列分离已经有8人回复
测序结果显示连上了，但是序列不对，连上的序列数据库中找不到，怎么回事已经有3人回复
为什么测得的序列在NCBI里blast不出来？已经有13人回复
SOS，求助，NCBI上引物比对问题已经有6人回复
测序结果不是我想要的片段！很急！！已经有17人回复
at克隆测序后只能查到一个引物序列已经有6人回复
转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答已经有5人回复
基因测序对比之后，该怎样判断下一步怎么做。已经有3人回复
DGGE测序后所得的序列要提交吗已经有5人回复
目的基因连接到克隆载体后提取质粒测序，序列有问题已经有11人回复
基因测序结果比对已经有5人回复
已经克隆测序到了matK序列，如何界定？急切求助中，谢谢！已经有10人回复
测序后的DNA序列与预测的有几个碱基不同，怎么办已经有18人回复
【求助/交流】测序时，为什么测序结果是与目的碱基序列反向互补的序列呢？已经有6人回复
【求助/交流】刚测序回来的序列，请帮忙分析一下！已经有7人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-04-17 20:11:04

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

haitian0625

金虫 (小有名气)

应助: 7 (幼儿园)
金币: 1392.4
帖子: 123
在线: 56.9小时
虫号: 903890

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lstt09nk(金币+2): 鼓励交流，欢迎常来 2011-04-18 11:27:23
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:34:37

你说的两个都行，第一个就是BLAST后看不同碱基的地方；第二个就是峰图上某个碱基的位置，出现上、下两个峰，就是SNP了。

赞一下(2人)

回复此楼

2楼2011-04-18 08:58:20

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

应助: 64 (初中生)
金币: 973.3
帖子: 759
在线: 361.7小时
虫号: 433819

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lstt09nk(金币+1): 感谢推荐，希望对楼主有所帮助~~ 2011-04-18 11:27:45
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:35:42

CodonCode Aligner
这个软件相当好用。

赞一下(3人)

回复此楼

3楼2011-04-18 10:40:23

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

xu19850927

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1241.4
帖子: 259
在线: 96.4小时
虫号: 857892

引用回帖:

Originally posted by xu19850927 at 2011-04-17 20:11:04:
我最近做的课题是扩增人的基因组DNA，然后测序，现在已经得到测序的结果，请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么？有人说用Blast，或者看峰图，有没有做过这方面的实验的解答一下，多谢

再细问一下，用blast要注意什么？难道只要不一样的位点就是SNP？怎么来验证一下

赞一下

回复此楼

4楼2011-04-23 11:35:22

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖