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【求助】关于测序后序列对比的问题
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xu19850927
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[交流]
【求助】关于测序后序列对比的问题
我最近做的课题是扩增人的基因组DNA,然后测序,现在已经得到测序的结果,请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么?有人说用Blast,或者看峰图,有没有做过这方面的实验的解答一下,多谢
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2011-04-17 20:11:04
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haitian0625
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):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+2): 鼓励交流,欢迎常来 2011-04-18 11:27:23
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:34:37
你说的两个都行,第一个就是BLAST后看不同碱基的地方;第二个就是峰图上某个碱基的位置,出现上、下两个峰,就是SNP了。
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2楼
2011-04-18 08:58:20
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xiadongliang
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+1): 感谢推荐,希望对楼主有所帮助~~ 2011-04-18 11:27:45
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:35:42
CodonCode Aligner
这个软件相当好用。
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2011-04-18 10:40:23
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xu19850927
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Originally posted by
xu19850927
at 2011-04-17 20:11:04:
我最近做的课题是扩增人的基因组DNA,然后测序,现在已经得到测序的结果,请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么?有人说用Blast,或者看峰图,有没有做过这方面的实验的解答一下,多谢
再细问一下,用blast要注意什么?难道只要不一样的位点就是SNP?怎么来验证一下
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2011-04-23 11:35:22
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直接用dnaman呗
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