24小时热门版块排行榜    

查看: 1456  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xu19850927

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】关于测序后序列对比的问题

我最近做的课题是扩增人的基因组DNA,然后测序,现在已经得到测序的结果,请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么?有人说用Blast,或者看峰图,有没有做过这方面的实验的解答一下,多谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xu19850927

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by xu19850927 at 2011-04-17 20:11:04:
我最近做的课题是扩增人的基因组DNA,然后测序,现在已经得到测序的结果,请问最常规对比序列寻找SNP的方法是什么?有人说用Blast,或者看峰图,有没有做过这方面的实验的解答一下,多谢

再细问一下,用blast要注意什么?难道只要不一样的位点就是SNP?怎么来验证一下
4楼2011-04-23 11:35:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

haitian0625

金虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+2): 鼓励交流,欢迎常来 2011-04-18 11:27:23
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:34:37
你说的两个都行,第一个就是BLAST后看不同碱基的地方;第二个就是峰图上某个碱基的位置,出现上、下两个峰,就是SNP了。
2楼2011-04-18 08:58:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+1): 感谢推荐,希望对楼主有所帮助~~ 2011-04-18 11:27:45
xu19850927(金币+5): 谢谢 2011-04-23 11:35:42
CodonCode Aligner
这个软件相当好用。
3楼2011-04-18 10:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +7 慕寒mio 2026-03-16 7/350 2026-03-19 10:57 by w沐阳w
[考研] 321求调剂 +6 何润采123 2026-03-18 6/300 2026-03-19 10:55 by daliangogo
[考研] 一志愿天大材料与化工(085600)总分338 +5 蔡大美女 2026-03-13 5/250 2026-03-19 10:44 by 是小刘呀~
[考研] 0703化学调剂 +8 妮妮ninicgb 2026-03-15 12/600 2026-03-19 05:55 by anny19840123
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 085600材料与化工 +5 安全上岸! 2026-03-16 5/250 2026-03-18 15:33 by cmz0325
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +7 ZY-05 2026-03-13 8/400 2026-03-18 14:13 by 007_lilei
[考研] 303求调剂 +4 睿08 2026-03-17 6/300 2026-03-18 11:01 by Iveryant
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 268求调剂 +7 好运连绵不绝 2026-03-12 8/400 2026-03-17 20:28 by xilongliang
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +6 Losir 2026-03-12 7/350 2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
信息提示
请填处理意见