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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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s10010251

木虫 (小有名气)

[求助] ncbi序列比对结果显示灰色小写字母

如图示,在做过BLAST搜索后,发现结果中出现小写灰色字母,不知什么意思,请教各位。
另外,请问NCBI里哪个地方有对此比较结果各种参数的详细解释,谢谢!
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s10010251(金币+1): 谢谢参与
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2楼2014-03-03 15:21:36
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3楼2014-03-03 15:21:40
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4楼2014-03-03 15:24:30
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5楼2014-03-03 15:31:19
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6楼2014-03-03 15:42:14
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)

建议楼主截张图看看
植根于内心的修养;无需提醒的自觉;以约束为前提的自由;为别人着想的善良
7楼2014-03-03 17:42:58
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马诺克

铁虫 (初入文坛)

小写部分为低复杂度的序列,像简单重复序列等。
此功能在设计引物时有用,如果发现我们要检测的基因含有此类序列,应尽量避免扩增这一区域,因为Taq酶在此区域可能发生滑动,从而导致扩增出现错误。
每一天 不一样的自己
8楼2014-04-27 19:27:23
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

楼上正解!
9楼2014-04-27 22:30:00
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su-qiong

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 马诺克 at 2014-04-27 19:27:23
小写部分为低复杂度的序列,像简单重复序列等。
此功能在设计引物时有用,如果发现我们要检测的基因含有此类序列,应尽量避免扩增这一区域,因为Taq酶在此区域可能发生滑动,从而导致扩增出现错误。

那一定要扩增怎么办。测序完后发现小写部分缺了两个。怎么办呢?
10楼2014-10-28 17:02:18
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