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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » ncbi序列比对结果显示灰色小写字母
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s10010251

木虫 (小有名气)

[求助] ncbi序列比对结果显示灰色小写字母

如图示，在做过BLAST搜索后，发现结果中出现小写灰色字母，不知什么意思，请教各位。
另外，请问NCBI里哪个地方有对此比较结果各种参数的详细解释，谢谢！
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1楼2014-03-03 15:11:02
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马诺克

铁虫 (初入文坛)
小写部分为低复杂度的序列，像简单重复序列等。
此功能在设计引物时有用，如果发现我们要检测的基因含有此类序列，应尽量避免扩增这一区域，因为Taq酶在此区域可能发生滑动，从而导致扩增出现错误。
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每一天 不一样的自己
8楼2014-04-27 19:27:23
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tmeisu
★
s10010251(金币+1): 谢谢参与
支持
2楼2014-03-03 15:21:36
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西门吹雪170

荣誉版主 (职业作家)
建议楼主截张图看看
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植根于内心的修养；无需提醒的自觉；以约束为前提的自由；为别人着想的善良
7楼2014-03-03 17:42:58
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su-qiong

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 马诺克 at 2014-04-27 19:27:23
小写部分为低复杂度的序列，像简单重复序列等。
此功能在设计引物时有用，如果发现我们要检测的基因含有此类序列，应尽量避免扩增这一区域，因为Taq酶在此区域可能发生滑动，从而导致扩增出现错误。

那一定要扩增怎么办。测序完后发现小写部分缺了两个。怎么办呢？
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10楼2014-10-28 17:02:18
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