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geniusrkx

铁杆木虫 (小有名气)

才虫

[求助] SOS,求助,NCBI上引物比对问题

我进行引物比对的时候,总是选择种属这里出问题,显示黄色的,怎么改也不行,求助各位大侠!
SOS,求助,NCBI上引物比对问题
NCBI-primer.png
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我活着,我精彩
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geniusrkx

铁杆木虫 (小有名气)

才虫

那个位置应该怎么选???
我活着,我精彩
2楼2013-11-13 17:49:56
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gyesang

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你想改成哪个物种呢,想改成哪个物种就输入那个物种的拉丁名
比如是人类的话,就输入 homo sapiens,不用全输,输入前几个字母就有提示了
小鼠 mus.....
.......................................
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-11-13 18:19:40
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Lovebirdshs

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流! 2013-11-13 21:22:58
geniusrkx: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-13 21:30:57
如果能够明确目的片段物种来源一般可以据物种选择,如果不清楚或者选择了已知物种却BLAST不到扩增产物,可以采取下列方法1》database选择nr, 系统会在数据库内所有物种中自动匹配所有可能的扩增结果,每一结果都附有物种来源,只选你感兴趣的看就可以了。2》手里有待扩增基因片段序列,database选择custom模式并提交基因序列即可,只搜索比对该片段内有无非特异扩增
希望能对你有所帮助,祝好运
孤独的舞者
4楼2013-11-13 19:22:19
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geniusrkx

铁杆木虫 (小有名气)

才虫

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-13 18:19:40
你想改成哪个物种呢,想改成哪个物种就输入那个物种的拉丁名
比如是人类的话,就输入 homo sapiens,不用全输,输入前几个字母就有提示了
小鼠 mus.....
.......................................

我是想改成阿米巴属,提示里面也有,可是选了之后,框还是黄色的,接下来的结果也是没有,怎么办
我活着,我精彩
5楼2013-11-13 21:31:54
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gyesang

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【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by geniusrkx at 2013-11-13 21:31:54
我是想改成阿米巴属,提示里面也有,可是选了之后,框还是黄色的,接下来的结果也是没有,怎么办...

框是黄色的,有什么关系呢?框显示黄色,只是系统的一种指示,你修改过了默认参数,不出结果的话,是不是引物本身就没有匹配的序列
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2013-11-14 00:29:27
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geniusrkx

铁杆木虫 (小有名气)

才虫

引用回帖:
6楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-14 00:29:27
框是黄色的,有什么关系呢?框显示黄色,只是系统的一种指示,你修改过了默认参数,不出结果的话,是不是引物本身就没有匹配的序列...

比对不出来结果啊,我用确定能扩增出那个属的阿米巴特异性引物试了一下,结果都说找不到我选的属,怎么办捏~~~
我活着,我精彩
7楼2013-11-14 08:49:51
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