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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yeshui

铁虫 (小有名气)

[求助] NCBI中的BLAST使用

我想查一下某种蛋白在哪些菌中存在,要使用NCBI中BLAST,但是不知道怎么做,希望亲们指点啊,谢谢哦,详细点哦
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good! 2011-10-19 18:33:17
进NCBI点BLAST,选择protein blast,把你的蛋白序列输入进去,点Algorithm parameters改变参数,点BLAST,出结果。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2011-10-19 07:51:23
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yeshui

铁虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-10-19 07:51:23:
进NCBI点BLAST,选择protein blast,把你的蛋白序列输入进去,点Algorithm parameters改变参数,点BLAST,出结果。

我所知道的是蛋白的核苷酸序列,怎么做呢?是不是输入核苷酸序列,然后选择others数据库的nr,然后点blast呢?
3楼2011-10-19 11:18:17
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by yeshui at 2011-10-19 11:18:17:
我所知道的是蛋白的核苷酸序列,怎么做呢?是不是输入核苷酸序列,然后选择others数据库的nr,然后点blast呢?

用blastx可以的。
4楼2011-10-19 17:48:09
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cloverplm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

核苷酸序列翻译成蛋白序列不就OK~\(≧▽≦)/~啦啦啦
净——静——竞——进
5楼2011-10-19 22:42:50
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yeshui

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cloverplm at 2011-10-19 22:42:50:
核苷酸序列翻译成蛋白序列不就OK~\(≧▽≦)/~啦啦啦

那样会很麻烦啊
6楼2011-10-21 14:53:18
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cloverplm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by yeshui at 2011-10-21 14:53:18:
那样会很麻烦啊


蛋白序列核核苷酸序列都可以直接blast 的,选好参数就可以,还有我实在想不通核苷酸翻译成蛋白有多复杂,那么多生物软件干嘛用的呢?
飘过
净——静——竞——进
7楼2011-10-21 16:41:04
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blastfeng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你使用SWSS使用比较好,是最大的蛋白质数据库
生活就像PCR
8楼2011-10-21 21:49:23
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

yeshui(金币+5): 2011-10-22 18:41:49
真相是最大的奢侈品
9楼2011-10-22 10:29:51
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yeshui

铁虫 (小有名气)

wanhscn: 重新下载试试看! 2011-10-22 21:22:40
引用回帖:
9楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-22 10:29:51:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923

怎么下到27%就不动了呢?
10楼2011-10-22 19:04:41
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