应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » NCBI中的BLAST使用
131/2返回列表12下一页
查看: 3770  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yeshui

铁虫 (小有名气)

[求助] NCBI中的BLAST使用

我想查一下某种蛋白在哪些菌中存在，要使用NCBI中BLAST，但是不知道怎么做，希望亲们指点啊，谢谢哦，详细点哦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-10-18 20:17:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): Good！ 2011-10-19 18:33:17
进NCBI点BLAST，选择protein blast，把你的蛋白序列输入进去，点Algorithm parameters改变参数，点BLAST，出结果。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

yeshui
2楼2011-10-19 07:51:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeshui

铁虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2011-10-19 07:51:23:
进NCBI点BLAST，选择protein blast，把你的蛋白序列输入进去，点Algorithm parameters改变参数，点BLAST，出结果。

我所知道的是蛋白的核苷酸序列，怎么做呢？是不是输入核苷酸序列，然后选择others数据库的nr，然后点blast呢？
赞一下 回复此楼
3楼2011-10-19 11:18:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by yeshui at 2011-10-19 11:18:17:
我所知道的是蛋白的核苷酸序列，怎么做呢？是不是输入核苷酸序列，然后选择others数据库的nr，然后点blast呢？

用blastx可以的。
赞一下 回复此楼
4楼2011-10-19 17:48:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloverplm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

核苷酸序列翻译成蛋白序列不就OK~\(≧▽≦)/~啦啦啦
赞一下 回复此楼
净——静——竞——进
5楼2011-10-19 22:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeshui

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cloverplm at 2011-10-19 22:42:50:
核苷酸序列翻译成蛋白序列不就OK~\(≧▽≦)/~啦啦啦

那样会很麻烦啊
回复此楼
6楼2011-10-21 14:53:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloverplm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by yeshui at 2011-10-21 14:53:18:
那样会很麻烦啊


蛋白序列核核苷酸序列都可以直接blast 的，选好参数就可以，还有我实在想不通核苷酸翻译成蛋白有多复杂，那么多生物软件干嘛用的呢？
飘过
赞一下 回复此楼
净——静——竞——进
7楼2011-10-21 16:41:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blastfeng

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你使用SWSS使用比较好，是最大的蛋白质数据库
赞一下 回复此楼
生活就像PCR
8楼2011-10-21 21:49:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

yeshui(金币+5): 2011-10-22 18:41:49
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923
赞一下 回复此楼
真相是最大的奢侈品
9楼2011-10-22 10:29:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeshui

铁虫 (小有名气)
wanhscn: 重新下载试试看! 2011-10-22 21:22:40
引用回帖:
9楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-22 10:29:51:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923

怎么下到27%就不动了呢？
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-10-22 19:04:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yeshui 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭