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mailchensu

铁虫 (小有名气)

[求助] 寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank,申请accession number 的专家-谢谢!

寻求可以帮我把测到的2株细菌的16s rDNA序列提交到Genbank 的专家。筛选到了2株细菌,想申请accession number,群里面的相关介绍也看了一下,提交过程很复杂,对微生物及分子生物学这方面我又很不了解,期待可以找到一位这方面的专家帮助我一下。非常感谢!
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瓶儿花

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

mailchensu(金币+10): 谢谢!完全同意你的介绍。 2011-09-02 18:08:05
先在GeneBank上注册个账号,然后会直接转至提交的页面让你提交序列的。按照那个上面来就好了,过几天就会给你发邮件通知你的。一般1-2个月后登录号就有了。
2楼2011-09-02 15:16:21
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zhaoyu2881

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

mailchensu(金币+10): 谢谢! 2011-09-05 14:13:16
提交序列一般有两种方法,一种是在线提交Bankit,另外一种是用软件提交Sequin。
http://liucheng.name/466/
这里介绍的是bankit旧版的操作过程,现在改为新版,内容大同小异,就是提前注册一个账号,然后按照页面提示,把你的菌株的基本信息填写进去,如果过程中出错会有提示,提交后genebank也会有邮件通知你的提交情况。
Thatislife,onlylifehurts.
3楼2011-09-03 16:26:20
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kingleo99

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

mailchensu(金币+10): 非常感谢! 2011-09-08 20:00:40
16s rDNA序列提交到Genbank,需要以下步骤:1)先在BLAST上比对确定你的细菌分类地位 2)然后建立一个TXT文档,里面按照以下格式:>此处填写你的菌株编号[organism=此处填写你的菌株的种属]  [strain=此处是你的菌株编号] 后面紧跟上是你的序列 3)然后将这个文档导入到sequin软件中进行编辑所生成的文件保存4)最后将该文件通过邮件形式发送到NCBI中(邮件地址在你使用sequin软件编辑时系统会自动告诉你)。祝你提交成功!
科学就是发现规律,而规律是上帝创造的,认识独一上帝就是智慧。
4楼2011-09-08 17:30:35
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