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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】设计的引物在NCBI blast中比对居然没有我的目的片段
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happylittlep

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】设计的引物在NCBI blast中比对居然没有我的目的片段 已有3人参与

我设计了一对引物，匹配性很好，软件评分也很高。但是在NCBI blast中比对的时候，居然没有我设计引物依据的那段序列。很着急啊，不知道这对引物能不能用。哪位朋友，知道给解答一下。谢谢啦。
刚领了俩金币，谁能给我解决这个问题，我就给谁。不多，算一点回报吧。呵呵

[ Last edited by happylittlep on 2011-3-15 at 13:34 ]
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我是搞通过基因细菌检测的，有相似课题的交流下哈。
1楼 2011-03-15 13:30:35
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happylittlep

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by happylittlep at 2011-03-15 13:30:35:
我设计了一对引物，匹配性很好，软件评分也很高。但是在NCBI blast中比对的时候，居然没有我设计引物依据的那段序列。很着急啊，不知道这对引物能不能用。哪位朋友，知道给解答一下。谢谢啦。
刚领了俩金币，谁 ...

没人理。。。唉
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我是搞通过基因细菌检测的，有相似课题的交流下哈。
2楼2011-03-19 14:35:26
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smiled001

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖内容被屏蔽
3楼2011-03-19 15:58:28
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你是用你自己的序列设计的？可能NCBI里面没有相关的上传序列吧，很正常，你跑下试试呗，合成一对引物也才50-60元吧，约4天，试试不就知道了
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4楼2011-03-19 16:02:30
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happylittlep

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-03-19 16:02:30:
你是用你自己的序列设计的？可能NCBI里面没有相关的上传序列吧，很正常，你跑下试试呗，合成一对引物也才50-60元吧，约4天，试试不就知道了

我用的序列是从网上下载下来的。而且都是保守序列。我需要用现有的数据支持我的设计，不是单单扩增出来就可以了。
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我是搞通过基因细菌检测的，有相似课题的交流下哈。
5楼2011-06-15 11:38:27
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by happylittlep at 2011-06-15 11:38:27:
我用的序列是从网上下载下来的。而且都是保守序列。我需要用现有的数据支持我的设计，不是单单扩增出来就可以了。

自己将alignment的图放上去不就可以了，一般审稿人不会纠结于这个问题吧。。
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6楼2011-06-15 14:59:27
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