应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】NCBI blast 具体
91/1返回列表
查看: 2252  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zouting

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】NCBI blast 具体 已有5人参与

鉴定细菌，提取DNA，PCR扩增16s rRNA并测序得到序列，要NCBI blast 搜索，不知道用BLAST Assembled Genomes，还是Basic BLAST？如果选前者，请具体说明一下怎么操作。如果用后者的nucleotide blast，Choose Search Set中的Database应该选哪一个呀？谢谢了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-06-12 16:57:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mazhenning

新虫 (初入文坛)
★ ★
scelab(金币+2):你最好弄几张图上来，呵呵 2010-06-12 22:56:15
zouting(金币+1):是搜索序列相似性最高的，谢谢 2010-06-14 08:58:55
是二者比对，还是从数据库中搜索与你的序列相似性最高的？
如果是后者，到NCBI的blast页面，选择nucleotide blast，数据库选others，也就是（nr/nt）.
不知道我有没有理解你的意思，呵呵。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-06-12 22:25:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dhmdddd

木虫 (正式写手)
★
zouting(金币+1): 2010-06-14 08:56:54
lstt09nk(金币+1):很热心~~ 2010-06-14 21:56:17
论坛里好象有怎么用NCBI的中文版，你搜下了，如果不行的话你的邮箱？给你发过去！！
赞一下(1人) 回复此楼
上班族，学习ing……
3楼2010-06-13 10:12:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zouting

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by mazhenning at 2010-06-12 22:25:58:
是二者比对，还是从数据库中搜索与你的序列相似性最高的？
如果是后者，到NCBI的blast页面，选择nucleotide blast，数据库选others，也就是（nr/nt）.
不知道我有没有理解你的意思，呵呵。

比对过了，看来是我提的不纯或者是引物特异性还不够，比对出来好多都是99%的
赞一下 回复此楼
4楼2010-06-14 09:06:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zouting

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dhmdddd at 2010-06-13 10:12:35:
论坛里好象有怎么用NCBI的中文版，你搜下了，如果不行的话你的邮箱？给你发过去！！

恩，我有一个PDF 介绍的，但是不是很清楚。麻烦你发一个给我吧，zouting0723@163.com
谢谢了
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-14 09:08:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zouting

金虫 (小有名气)
还想请教一下，PCR产物直接鉴定是不是效果比较差呀
赞一下 回复此楼
6楼2010-06-17 11:21:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rabbit9355

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by mazhenning at 2010-06-12 22:25:58:
是二者比对，还是从数据库中搜索与你的序列相似性最高的？
如果是后者，到NCBI的blast页面，选择nucleotide blast，数据库选others，也就是（nr/nt）.
不知道我有没有理解你的意思，呵呵。

能不能给我也发一个？cherrychj@163.com
赞一下 回复此楼
7楼2010-06-25 19:54:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yoyoyoyo3985

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by rabbit9355 at 2010-06-25 19:54:39:

能不能给我也发一个？cherrychj@163.com

嘿嘿，搭车同申请，给我也发一个吧，谢谢
dxlxp@163.com
赞一下 回复此楼
难免埋怨时间的手，把相爱写成相爱过
8楼2010-06-25 21:36:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiyawei

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
能不能也给我发一下呀applejiyawei@sina.com  谢谢
赞一下 回复此楼
坚持就是胜利！
9楼2014-02-22 00:26:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zouting 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +3 Mqqqqqq 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:11 by peike
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[教师之家] 焦虑 +9 水冰月月野兔 2026-03-13 13/650 2026-03-19 09:50 by otani
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-18 22:35 by bingxueer79
[考研] 295求调剂 +3 一志愿京区211 2026-03-18 5/250 2026-03-18 17:03 by zhaoqian0518
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 9/450 2026-03-18 15:05 by stone_128
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +5 梨花珞晚风 2026-03-17 5/250 2026-03-18 14:49 by haxia
[考研] 311求调剂 +11 冬十三 2026-03-15 12/600 2026-03-18 14:36 by 星空星月
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 278求调剂 +5 烟火先于春 2026-03-17 5/250 2026-03-18 08:43 by 星空星月
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 0703 物理化学调剂 +3 我可以上岸的对� 2026-03-13 5/250 2026-03-16 10:50 by 我可以上岸的对�
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭