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一一8778

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】于NCBI上的Uncultured bacterium 准确解释一下这是什么细菌 已有6人参与

于ncbi上blast后出来很多Uncultured bacterium 这个样是细菌,我想知道的是,这是未鉴定的细菌,还是未培养的细菌?
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cnlics

木虫 (小有名气)

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1949stone(金币+2):谢谢交流 2010-09-12 13:11:46
未能培养的细菌。这些细菌也可以说是未鉴定的,现在metagenomics也就是宏基因组是一个热点,这种方法可以发现大量uncultured bacterium。

将来,随着研究的集中,某些细菌肯定由uncultured状态,培养出多个菌株,甚至成为新的模式菌株。
2楼2010-09-12 13:07:37
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刘玉

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
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scelab(金币+2):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-09-13 12:50:43
我觉得是不可培养微生物,毕竟好像有95%的微生物(还是细菌,既不清了)是不可培养的。
3楼2010-09-12 18:43:39
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王家大成

木虫 (正式写手)

囧囧小虫

★ ★ ★
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scelab(金币+2):谢谢交流!:tiger06: 2010-09-13 12:50:36
不能纯培养的一类微生物,很多都是利用宏基因组学发现的,比如土壤、瘤胃等环境的宏基因组学技术。
一念起,万水千山;一念灭,沧海桑田!
4楼2010-09-13 12:48:08
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David_wyq

金虫 (小有名气)


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请问问题解决了么?到底是为鉴定的还是未培养的?本人认为是未培养的,因为我觉得有一些uncultured 的16s 序列,但是这些uncultured的菌的序列又是如何获取的呢?麻烦了,谢谢
读万卷书不如行万里路,行万里路不如阅人无数,阅人无数不如名师指路。
5楼2014-04-29 09:13:33
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c258520314

金虫 (正式写手)


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宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段, 以微生物多样性、 种群结构、 进化关系、 功能活性、 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。
一般包括从环境样品中提取基因组 DNA, 进行高通量测序分析,或克隆DNA到合适的载体,导入宿主菌体,筛选目的转化子等工作。
知我者谓我何忧,不知者谓我何求。
6楼2014-10-27 14:44:56
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
未分离培养的细菌。有时候提交人懒得花功夫一个个注明,就干脆统统标Uncultured bacterium了,如果你看提交人发表的文章,没准会发现有的其实知道是哪一类菌。
7楼2014-10-27 15:48:50
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