24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (3871)
>虫友互识 (589)
>文献求助 (483)
>导师招生 (356)
>考博 (200)
>休闲灌水 (188)
>论文投稿 (177)
>硕博家园 (135)
>基金申请 (116)
>招聘信息布告栏 (93)
>博后之家 (81)
>教师之家 (66)
>论文道贺祈福 (60)
>找工作 (41)
>公派出国 (41)
>考研 (41)

返回列表

上官小小

木虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 2002.7
帖子: 75
在线: 21小时
虫号: 1059966

[交流] 【求助/交流】NCBI中细菌Blast比对100%能不能说是一个种

我测序得到一株菌，经NCBI Blast 比对后发现有三株菌的 Max score 相同；Total score相同；Query coverage 100% ； E value 均是0 ；Max ident 都是100%。我能不能说我得到的这个菌，与比对的那两个菌是同一个种，它们是一模一样的？还用不用鉴定G+C%含量，做DNA-DNA杂交？

回复此楼

» 猜你喜欢

拟解决的关键科学问题还要不要写已经有8人回复
存款400万可以在学校里躺平吗已经有28人回复
最失望的一年已经有11人回复
求推荐英文EI期刊已经有5人回复
请教限项目规定已经有4人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？已经有20人回复
26申博已经有3人回复
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？已经有10人回复
基金申报已经有6人回复
疑惑？已经有5人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

求助：细菌浓度的测量已经有27人回复
【教程】NCBI、blast相关教程已经有233人回复
在NCBI中查到一个基因怎么看操纵子和启动子区域？已经有20人回复
PCR后测序，blast最高匹配度只有32% 已经有3人回复
NCBI中的BLAST使用已经有12人回复
细菌鉴定--blast后一定要再到Genbank中检索才能确定什么菌，得到accession number吗？已经有12人回复
NCBI上BLAST结果的标题翻译成中文，怎么样更准确？已经有3人回复
【求助/交流】如何用NCBI的BLAST来找到一个基因的保守序列? 已经有11人回复
【求助/交流】设计的引物在NCBI blast中比对居然没有我的目的片段已经有5人回复
【求助/交流】我做了SSH，测序了400个。反转录序列与NCBI比对还用将其反向吗已经有3人回复
【求助/交流】请教一个NCBI上注释的问题已经有5人回复
【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题已经有6人回复
【求助/交流】NCBI blast 具体已经有8人回复
NCBI blast 结果一些参数的含义求高手指点已经有12人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-02-24 23:18:57

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

★
上官小小(金币+1):谢谢参与
上官小小(金币+1): 2011-02-25 15:01:54

看你接下来这个菌用来干什么了，如果不是专门发表细菌鉴定及分类的文章的话就不用再做了。

不过貌似你的菌也不是什么新种，所以做那些貌似也没有多大必要了。

写文章的时候也没必要说和它就是同一个种，只说16S序列的相似性100%就行了，

大家都明白怎么回事儿。

[ Last edited by brightfuture01 on 2011-2-24 at 23:26 ]