24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2003  |  回复: 3

上官小小

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】NCBI中细菌Blast比对100%能不能说是一个种

我测序得到一株菌,经NCBI Blast 比对后发现有三株菌的 Max score 相同 ;Total score相同 ;Query coverage 100% ; E value 均是0   ;Max ident 都是100%。我能不能说我得到的这个菌,与比对的那两个菌是同一个种,它们是一模一样的?还用不用鉴定G+C%含量,做DNA-DNA杂交?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上官小小(金币+1):谢谢参与
上官小小(金币+1): 2011-02-25 15:01:54
看你接下来这个菌用来干什么了,如果不是专门发表细菌鉴定及分类的文章的话就不用再做了。

不过貌似你的菌也不是什么新种,所以做那些貌似也没有多大必要了。

写文章的时候也没必要说和它就是同一个种,只说16S序列的相似性100%就行了,

大家都明白怎么回事儿。

[ Last edited by brightfuture01 on 2011-2-24 at 23:26 ]
2楼2011-02-24 23:25:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

charon1982

铁杆木虫 (著名写手)



上官小小(金币+1):谢谢参与
上官小小(金币+1): 2011-02-25 15:01:51
16s 同源性大于97%,可以认为是同一个种,但有例外,有同源性100%鉴定为不同种的;如果你没有发现生理生化等表值特征差异或新功能,没有必要再去鉴定
3楼2011-02-25 08:31:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rural2084

木虫 (正式写手)



上官小小(金币+1):谢谢参与
上官小小(金币+1): 2011-02-25 15:01:46
不一定,只要大于97%,就可能是一个种,有时比对下来有几个种是大于97%的,即使是100%也要跟模式菌株进行比对
4楼2011-02-25 08:43:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 上官小小 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工调剂 10+11 下一站上岸@ 2026-04-10 39/1950 2026-04-13 10:25 by sxdj2
[考研] 本科生物信息学,总分362 求07 08调剂 +7 q小倩1210 2026-04-06 7/350 2026-04-13 10:22 by 可淡不可忘
[考研] 一志愿哈工大 085600 277 12材科基求调剂 5+5 chenny174 2026-04-10 33/1650 2026-04-13 08:50 by Sammy2
[考研] 277求调剂 +23 倪建设 2026-04-06 23/1150 2026-04-13 00:40 by 王童子龙
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 考研求调剂 +3 ban班小七 2026-04-11 3/150 2026-04-11 20:48 by may_新宇
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +16 叶zilin 2026-04-10 16/800 2026-04-11 11:04 by may_新宇
[考研] 298求调剂 +5 残荷新柳 2026-04-07 5/250 2026-04-11 11:02 by 紫曦紫棋
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 调剂 +12 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 13/650 2026-04-10 22:36 by Ftglcn90
[考研] 本科西工大 324求调剂 +4 wysyjs25 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:00 by 来看流星雨10
[考研] 314求调剂 +18 xhhdjdjsjks 2026-04-09 19/950 2026-04-10 18:53 by HPUCZ
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 083200 初试305分 求调剂 暂不考虑跨专业 +15 Claireyyyy 2026-04-09 15/750 2026-04-09 16:11 by zhuimr
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-08 12/600 2026-04-09 14:27 by rl1980
[考研] 328求调剂 +17 lftmya 2026-04-07 18/900 2026-04-09 08:05 by 5268321
[考研] 材料工程专业日语生求调剂 +9 111623 2026-04-07 9/450 2026-04-07 23:31 by 一只好果子?
[考研] 338求调剂 +5 小猪红色 678 2026-04-06 6/300 2026-04-07 21:18 by 乔哒哒哒
信息提示
请填处理意见