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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请教一个NCBI上注释的问题
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pop_hjx_41

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请教一个NCBI上注释的问题 已有2人参与


想请教一个问题 如上图 怎么解释这句话呢 这个序列可信可以用吗？
谢谢高手指教了
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1楼 2010-09-19 23:50:01
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chentg

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这是别人测基因组序列或EST等后预测的蛋白质序列。
可信度很难说。要想保证它可信，必须查到它的核酸序列，最好该序列较长，再用多个基因预测方法预测一下。再进一步就是克隆该基因，看是否真的能表达出该蛋白，如能，即绝大多数情况下已可信也。
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我为人人，人人为我。
2楼2010-09-20 00:54:52
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chentg

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
下面图较小，看不清楚。
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我为人人，人人为我。
3楼2010-09-20 00:58:27
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pop_hjx_41

铜虫 (初入文坛)
是的 在NCBI上有这个较长的EST序列 拿出来去SMART上可以预测出对应的蛋白结构 应该是不是就比较可信呢？我现在想拿这个序列去设计引物去克隆相近物种中的这个基因 这样应该是不是可以呢？
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4楼2010-09-20 08:33:51
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chentg

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
一般提交上去还没有经过专家系统筛选确认的，一般要多加考虑是否它正确。
要保证成功，一要把该EST比对一下基因组序列，看是否在基因组序列上，如它在基因组序列上，且由内含子依次分隔，这样基本上可以确定。这个过程在NCBI上即可进行比对。二即是设计引物的问题了，设计的好，可调出相近物种的同源基因，设计特异性不好，不好说。
可怜，你也是刚注册的，铁虫，我早先年就在小木虫注册了，且有较多金币。现在忘记了用户名和密码，前几天才重新注册了一个。
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5楼2010-09-20 09:27:29
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pop_hjx_41

铜虫 (初入文坛)
我把它这个序列在Ensembl上找了下 发现在染色体的位置上有 而且就一个 是不是基本上可以确定了 设计了个引物在结构域里p一下试试吧 呵呵 谢谢您啦 有什么不明白的还得再问你哈
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6楼2010-09-21 10:35:52
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