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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】NCBI中细菌Blast比对100%能不能说是一个种
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上官小小

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】NCBI中细菌Blast比对100%能不能说是一个种

我测序得到一株菌，经NCBI Blast 比对后发现有三株菌的 Max score 相同 ；Total score相同 ；Query coverage 100% ； E value 均是0   ；Max ident 都是100%。我能不能说我得到的这个菌，与比对的那两个菌是同一个种，它们是一模一样的？还用不用鉴定G+C%含量，做DNA-DNA杂交？
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1楼 2011-02-24 23:18:57
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)
★
上官小小(金币+1):谢谢参与
上官小小(金币+1): 2011-02-25 15:01:51
16s 同源性大于97%，可以认为是同一个种，但有例外，有同源性100%鉴定为不同种的；如果你没有发现生理生化等表值特征差异或新功能，没有必要再去鉴定
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3楼2011-02-25 08:31:05
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