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ma_xiaowen木虫 (正式写手)
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想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
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想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 我是想从一种真菌中P一个基因，但是找到了几个类似的，只能得到它的蛋白序列，却找不到基因序列 ，想问下虫友们，如何找到啊，或者是否能从蛋白序列去设计引物。 还有就是，在这一种病害的另一种致病菌中找相同的基因，就能找到基因序列，这是为什么啊？ DBSOURCE accession 点开了 可是打开后也还是没有基因序列，是一部分一部分的蛋白序列 急需虫友们的帮助，小弟感激不尽啊 |
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cheng_xiao
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3楼2012-05-09 10:48:47
yabxxh
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【答案】应助回帖
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听你的意思，你是想做同源克隆啊，那你就不用找什么基因序列了，估计目前没有发表的。同一个基因在不同物种里面一般会有高度保守的序列的，就像小鼠的Klotho基因和人的Klotho基因具有很高的同源性一样。 你可以找到这个蛋白的CDS序列（如果其CDS序列是标出来的），去Blast，然后取其高度保守的部分，设计兼并引物来进行PCR，这样就可以了。 |
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ma_xiaowen6楼2012-05-10 15:28:37
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7楼2012-05-10 16:04:59
yangbin1
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