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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何通过一段序列，找到它上下游的序列？谢谢！
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a莫桑

新虫 (初入文坛)

[交流] 如何通过一段序列，找到它上下游的序列？谢谢！已有3人参与

我现在有一段20多长度的序列，怎么找到它前面五六十，加上后面五六十的碱基序列呢？
我在ncbi上blast之后，点了第一个配对最高的，点了FASTA之后出来几十万个碱基序列，我用页面搜索，却找不到我输入的那20多nt序列。请问我的方法有什么错误吗？
例如：

TCAGTGCACTACAGAACTTTGT

以及GTAAACATCCTTGACTGGAAGCT

我是新人。没什么金币。真的真的谢谢大家的帮助！时间紧急，拜托了！

[ Last edited by 1949stone on 2013-6-24 at 08:05 ]
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1楼2013-06-23 13:44:48
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1949stone: 金币+1, 同意 这些估计是后话了 2013-06-24 08:05:50
反向PCR，基因组文库，RACE。
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2楼2013-06-23 14:06:21
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tongyanna

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1949stone: 金币+1, 估计要是试到地老天荒了 2013-06-24 08:06:13
方向上的错误，或者互补的反向，都试试吧！
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自己的路，自己快乐的走
3楼2013-06-23 18:50:41
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zhaodahe

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1949stone: 金币+1, 有道理 2013-06-24 08:06:21
分值最高可能不完全匹配，而且这个序列是不是太短了？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2013-06-23 19:12:34
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