应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】请教高手核酸序列的位置问题
71/1返回列表
查看: 1351  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

飞扬886

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请教高手核酸序列的位置问题 已有4人参与

请问哪位知道怎样用生物信息学方法确定一段核酸序列在整个基因中的位置，请高手指教，谢谢啦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-07-20 15:51:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liouwzh

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):正解 2010-07-20 16:51:06
一般的方法是可以在NCBI通过同源比对，确定位置。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-07-20 16:49:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-07-20 16:50:59
去NCBI上面BLAST，网址为
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

比对后，在结果里面找到相关的基因组的那条信息，定位！
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-07-20 16:50:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞扬886

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-07-20 16:50:34:
去NCBI上面BLAST，网址为
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

比对 ...

谢谢，我也大概知道这种方法，但是blast出来结果后，再找出相关的基因，比query序列还短，我就不知道怎么回事了
赞一下 回复此楼
4楼2010-07-20 17:05:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 飞扬886 at 2010-07-20 17:05:32:


谢谢，我也大概知道这种方法，但是blast出来结果后，再找出相关的基因，比query序列还短，我就不知道怎么回事了

你是想知道你的基因大概的位置，如果不想做实验的话，就可能通过比对，看结果了，有些比对结果序列比你的序列还要短，有可能是相关的序列，网上的资源太少了，别人只是测了一小断，上传到genbank里面，如果相似度很高的话，一般还是可以相信的，你可以看看和你序列最相近的那条序列在基因组里哪个位置啊，是干什么用的，还有，如果你的序列是编码蛋白的话，还可以用NCBI 的ORF FINDER 得到蛋白序列再比，这些都是依据genbank里面的资源，如果不多就没办法了……
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-07-20 17:24:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tongyanna

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-07-20 17:24:02:

你是想知道你的基因大概的位置，如果不想做实验的话，就可能通过比对，看结果了，有些比对结果序列比你的序列还要短，有可能是相关的序列，网上的资源太少了，别人只是测了一小断，上传到genbank里面，如果相似 ...

好， 太好了
回复此楼
自己的路，自己快乐的走
6楼2010-07-20 17:38:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞扬886

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-07-20 17:24:02:

你是想知道你的基因大概的位置，如果不想做实验的话，就可能通过比对，看结果了，有些比对结果序列比你的序列还要短，有可能是相关的序列，网上的资源太少了，别人只是测了一小断，上传到genbank里面，如果相似 ...

讲得好详细， O(∩_∩)O谢谢 ！
赞一下 回复此楼
7楼2010-07-20 17:43:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 飞扬886 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:32 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:29 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:01 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:32 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-11 01:24 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:21 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:13 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 20:51 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 5/250 2026-11-10 20:45 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 4/200 2026-11-10 20:07 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 申请环境，微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭