24小时热门版块排行榜    

查看: 3404  |  回复: 9

happygjx

木虫 (小有名气)

[求助] 扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列

扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列?向达人请教?麻烦解释详细点,最好有个教程。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

科研

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

楼主意思是要找基因的5'到3'的方向吗?
jiayoubashaonian
2楼2011-11-19 21:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

第五平原

木虫 (正式写手)

同样请教这个问题啊。
勤勉
3楼2011-11-19 23:12:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对,就会显示出你这段序列在基因组中的位置,自然就能看到上下游的序列了
4楼2011-11-20 05:39:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Novel基因的话,须用RACE克隆技术。已知基因或许可以进行BLAST得到。
5楼2011-11-20 06:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
1楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-19 15:52:48:
扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列?向达人请教?麻烦解释详细点,最好有个教程。

对的,我是这个意思,扩增出一个基因片段,怎么通过基因组查找的5’和3’序列,也就是说不用跑RACE了
6楼2011-11-21 08:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 凡子1985 at 2011-11-20 05:39:25:
进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对,就会显示出你这段序列在基因组中的位置,自然就能看到上下游的序列了

谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思
7楼2011-11-21 08:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思

那也是一样的啊  NCBI 这个功能很简单  上网看看 学习一下
8楼2011-11-21 15:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思

好吧
9楼2011-11-22 08:51:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feichen2008

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

是什么上的基因?如果基因组全序列已知,就可以在NCBI上blast,确定该基因的位置,上下游序列自然能得到。如果基因组序列未知,要想得到5‘和3’序列就只能做RACE了。
10楼2011-12-03 11:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 happygjx 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[找工作] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:40 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 7/350 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 07:20 by E1iiBLMU2XnD
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 7ZYIEW2YWn72 2026-09-04 9/450 2026-09-06 06:00 by E1iiBLMU2XnD
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 CRJ0Aq2FtVH0 2026-09-03 15/750 2026-09-06 05:48 by E1iiBLMU2XnD
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 5/250 2026-09-06 02:39 by E1iiBLMU2XnD
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 5/250 2026-09-06 02:19 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 面上没中,邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!! +4 SCSIOyxguo 2026-09-03 7/350 2026-09-05 10:39 by Honglianlian
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
请填处理意见