24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 3191  |  回复: 9

happygjx

木虫 (小有名气)

[求助] 扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列

扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列?向达人请教?麻烦解释详细点,最好有个教程。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

科研

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

楼主意思是要找基因的5'到3'的方向吗?
jiayoubashaonian
2楼2011-11-19 21:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

第五平原

木虫 (正式写手)

同样请教这个问题啊。
勤勉
3楼2011-11-19 23:12:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对,就会显示出你这段序列在基因组中的位置,自然就能看到上下游的序列了
4楼2011-11-20 05:39:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Novel基因的话,须用RACE克隆技术。已知基因或许可以进行BLAST得到。
5楼2011-11-20 06:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
1楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-19 15:52:48:
扩增出一段序列,如何通过基因组查找上游和下游序列?向达人请教?麻烦解释详细点,最好有个教程。

对的,我是这个意思,扩增出一个基因片段,怎么通过基因组查找的5’和3’序列,也就是说不用跑RACE了
6楼2011-11-21 08:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 凡子1985 at 2011-11-20 05:39:25:
进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对,就会显示出你这段序列在基因组中的位置,自然就能看到上下游的序列了

谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思
7楼2011-11-21 08:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思

那也是一样的啊  NCBI 这个功能很简单  上网看看 学习一下
8楼2011-11-21 15:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢,我得到的是一段新基因,想通过基因组查找的5‘和3’序列,是这个意思

好吧
9楼2011-11-22 08:51:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feichen2008

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

是什么上的基因?如果基因组全序列已知,就可以在NCBI上blast,确定该基因的位置,上下游序列自然能得到。如果基因组序列未知,要想得到5‘和3’序列就只能做RACE了。
10楼2011-12-03 11:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 happygjx 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂推荐 +4 小聂爱学习 2026-04-14 4/200 2026-04-14 20:54 by fqwang
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 54/2700 2026-04-14 18:00 by lhj2009
[考研] 367求调剂 +11 hffQAQ 2026-04-09 11/550 2026-04-14 17:48 by lhj2009
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 085404 298分求调剂 +11 呼啦呼啦呼呼呼 2026-04-10 12/600 2026-04-14 08:38 by wfj257
[考研] 一志愿华南理工大学331分材料求调剂 +10 天下ww 2026-04-09 11/550 2026-04-13 23:25 by pies112
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 277 数一104,学硕,求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 0854调剂 +4 长弓傲 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:18 by 猪会飞
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 初试分332,一志愿报考西北工业大学, +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-08 12/600 2026-04-09 14:27 by rl1980
[考研] 二次调剂求老师收留 +3 笑笑袁 2026-04-08 3/150 2026-04-08 23:50 by 醉在风里
信息提示
请填处理意见