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happygjx

木虫 (小有名气)

[求助] 扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列

扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列？向达人请教？麻烦解释详细点，最好有个教程。
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1楼2011-11-19 15:52:48
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feichen2008

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

是什么上的基因？如果基因组全序列已知，就可以在NCBI上blast，确定该基因的位置，上下游序列自然能得到。如果基因组序列未知，要想得到5‘和3’序列就只能做RACE了。
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10楼2011-12-03 11:00:30
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

楼主意思是要找基因的5'到3'的方向吗？
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jiayoubashaonian
2楼2011-11-19 21:32:53
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第五平原

木虫 (正式写手)
同样请教这个问题啊。
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勤勉
3楼2011-11-19 23:12:28
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凡子1985

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对，就会显示出你这段序列在基因组中的位置，自然就能看到上下游的序列了
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4楼2011-11-20 05:39:25
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