应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列
101/1返回列表
查看: 3547  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

happygjx

木虫 (小有名气)

[求助] 扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列

扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列？向达人请教？麻烦解释详细点，最好有个教程。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

科研

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-11-19 15:52:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

楼主意思是要找基因的5'到3'的方向吗？
赞一下 回复此楼
jiayoubashaonian
2楼2011-11-19 21:32:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

第五平原

木虫 (正式写手)
同样请教这个问题啊。
赞一下 回复此楼
勤勉
3楼2011-11-19 23:12:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对，就会显示出你这段序列在基因组中的位置，自然就能看到上下游的序列了
赞一下 回复此楼
4楼2011-11-20 05:39:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

Novel基因的话，须用RACE克隆技术。已知基因或许可以进行BLAST得到。
赞一下 回复此楼
5楼2011-11-20 06:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-19 15:52:48:
扩增出一段序列，如何通过基因组查找上游和下游序列？向达人请教？麻烦解释详细点，最好有个教程。

对的，我是这个意思，扩增出一个基因片段，怎么通过基因组查找的5’和3’序列，也就是说不用跑RACE了
赞一下 回复此楼
6楼2011-11-21 08:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 凡子1985 at 2011-11-20 05:39:25:
进NCBI http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 进行比对，就会显示出你这段序列在基因组中的位置，自然就能看到上下游的序列了

谢谢，我得到的是一段新基因，想通过基因组查找的5‘和3’序列，是这个意思
赞一下 回复此楼
7楼2011-11-21 08:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凡子1985

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢，我得到的是一段新基因，想通过基因组查找的5‘和3’序列，是这个意思

那也是一样的啊  NCBI 这个功能很简单  上网看看 学习一下
赞一下 回复此楼
8楼2011-11-21 15:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happygjx

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by happygjx at 2011-11-21 08:08:44:
谢谢，我得到的是一段新基因，想通过基因组查找的5‘和3’序列，是这个意思

好吧
回复此楼
9楼2011-11-22 08:51:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feichen2008

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

是什么上的基因？如果基因组全序列已知，就可以在NCBI上blast，确定该基因的位置，上下游序列自然能得到。如果基因组序列未知，要想得到5‘和3’序列就只能做RACE了。
赞一下 回复此楼
10楼2011-12-03 11:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 happygjx 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 4/200 2026-11-07 10:03 by byEJ59EAM6hR
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 8/400 2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 12/600 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭