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a莫桑

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 2452062
注册: 2013-05-07

[交流] 如何通过一段序列，找到它上下游的序列？谢谢！已有3人参与

我现在有一段20多长度的序列，怎么找到它前面五六十，加上后面五六十的碱基序列呢？
我在ncbi上blast之后，点了第一个配对最高的，点了FASTA之后出来几十万个碱基序列，我用页面搜索，却找不到我输入的那20多nt序列。请问我的方法有什么错误吗？
例如：

TCAGTGCACTACAGAACTTTGT

以及GTAAACATCCTTGACTGGAAGCT

我是新人。没什么金币。真的真的谢谢大家的帮助！时间紧急，拜托了！

[ Last edited by 1949stone on 2013-6-24 at 08:05 ]

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1楼 2013-06-23 13:44:48

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tongyanna

金虫 (正式写手)

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性别: MM
专业: 水产生物遗传育种学

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1949stone: 金币+1, 估计要是试到地老天荒了 2013-06-24 08:06:13

方向上的错误，或者互补的反向，都试试吧！

自己的路，自己快乐的走

3楼2013-06-23 18:50:41

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