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gms2010

铜虫 (初入文坛)

[求助] 大侠们,我有一个2kb左右的基因,但我想寻找上下游的序列,改咋做呢?

大侠们,我有一个2kb左右的基因,但我想寻找上下游的序列,该咋做呢?
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gms2010

铜虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by panda73 at 2011-12-26 21:07:13:
如果是已测序的基因组,就很简单:直接blast就可以了
如果是未进行基因组测序的物种,那么可以利用基因组DNA按照侧翼序列克隆方案去克隆两端序列(好像是有成熟的kit提供全套的解决方案,你可以仔细查一查)

太感谢了!
6楼2011-12-27 09:36:45
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普通回帖

panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wanhscn(金币+6): good!欢迎常来! 2011-12-27 14:45:17
如果是已测序的基因组,就很简单:直接blast就可以了
如果是未进行基因组测序的物种,那么可以利用基因组DNA按照侧翼序列克隆方案去克隆两端序列(好像是有成熟的kit提供全套的解决方案,你可以仔细查一查)

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2楼2011-12-26 21:07:13
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引用回帖:
2楼: Originally posted by panda73 at 2011-12-26 21:07:13:
如果是已测序的基因组,就很简单:直接blast就可以了
如果是未进行基因组测序的物种,那么可以利用基因组DNA按照侧翼序列克隆方案去克隆两端序列(好像是有成熟的kit提供全套的解决方案,你可以仔细查一查)

3楼2011-12-26 21:28:35
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)

让一切随风飞翔

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-12-29 16:26:33
Tail PCR 是对已知序列插入位点鉴定的有效方法
一直向前!
4楼2011-12-27 07:59:44
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jting0912

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励新虫 2011-12-29 16:26:50
到NCBI上找你所要的全部序列,发送到你的文件夹里,使用Vector NTI软件对你的目的基因定位,目的基因前后就是你要的上下游序列。
5楼2011-12-27 09:15:34
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wanggl2004

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wanhscn(金币+2): 有道理! 2011-12-29 09:11:20
如果基因组没有测序,采用genome walking的方法,有这样的试剂盒,谷歌一下就能找到!
思考是行动的种子!
7楼2011-12-27 11:13:54
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jxnufangle

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wanggl2004 at 2011-12-27 11:13:54:
如果基因组没有测序,采用genome walking的方法,有这样的试剂盒,谷歌一下就能找到!

对,这样简单有效
8楼2011-12-28 19:34:39
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wanggl2004

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by jxnufangle at 2011-12-28 19:34:39:
对,这样简单有效

恩!
9楼2011-12-28 21:26:10
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