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gms2010

铜虫 (初入文坛)

[求助] 大侠们,我有一个2kb左右的基因,但我想寻找上下游的序列,改咋做呢?

大侠们,我有一个2kb左右的基因,但我想寻找上下游的序列,该咋做呢?
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jting0912

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励新虫 2011-12-29 16:26:50
到NCBI上找你所要的全部序列,发送到你的文件夹里,使用Vector NTI软件对你的目的基因定位,目的基因前后就是你要的上下游序列。
5楼2011-12-27 09:15:34
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查看全部 9 个回答

panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wanhscn(金币+6): good!欢迎常来! 2011-12-27 14:45:17
如果是已测序的基因组,就很简单:直接blast就可以了
如果是未进行基因组测序的物种,那么可以利用基因组DNA按照侧翼序列克隆方案去克隆两端序列(好像是有成熟的kit提供全套的解决方案,你可以仔细查一查)

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2楼2011-12-26 21:07:13
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引用回帖:
2楼: Originally posted by panda73 at 2011-12-26 21:07:13:
如果是已测序的基因组,就很简单:直接blast就可以了
如果是未进行基因组测序的物种,那么可以利用基因组DNA按照侧翼序列克隆方案去克隆两端序列(好像是有成熟的kit提供全套的解决方案,你可以仔细查一查)

3楼2011-12-26 21:28:35
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)

让一切随风飞翔

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-12-29 16:26:33
Tail PCR 是对已知序列插入位点鉴定的有效方法
一直向前!
4楼2011-12-27 07:59:44
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