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两个基因序列能不能做荧光定量PCR？请教大家一下！！！
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相似度为89%的两个基因序列能不能做荧光定量PCR 我想做醇脱氢酶（ADH）基因的表达检测，但ADH1与ADH2的基因序列有89%的相似度，请问各位高手：是否有办法通过设计不同的引物把2段基因中相似度较低的序列P出来，定量PCR？ 我设计过引物，好像ADH1与ADH2两条基因无法分开P出来，请大家解惑，谢谢！ |
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wanhscn
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2楼2011-08-27 21:33:00
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【答案】应助回帖
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amisking(金币+4, BioEPI+1): 想当专业啊！ 2011-08-28 20:21:44
amisking(金币+4, BioEPI+1): 想当专业啊！ 2011-08-28 20:21:44
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1.建议用探针法，设计引物理论上可以区别开差异。但是real-time引物质量还是有点要求的，很可能那仅有的差异序列不适合做引物（CT值低，TM低，有错配等等。） 2.探针法，比如：AB公司的Teq MAN 探针有一个专利，就是RGB小沟结合物（可提高局部TM）。因此它可以很好地区别差异序列，理论上13-18bp大小的探针序列中只要有2个碱基不同就能很好区分。杂志认可度高，方便今后投文章。 3.如果楼主没做过real-time。探针法的好处就更多了，你直接给序列给公司，公司一条龙服务。自己跑个PCR就好，省了实验设计阶段。 |
4楼2011-08-28 18:10:35
wanhscn
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5楼2011-08-28 19:45:10
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