应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构
131/2返回列表12下一页
查看: 3006  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ahui1883

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构 已有8人参与

最近测序获得一段序列，想知道其中是不是含有编码基因的序列，还有就是编码什么基因，这个应该怎么查找啊。请各位大侠帮忙，不胜感激啊。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
1楼 2010-06-25 10:01:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ilxly

木虫 (小有名气)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-06-25 10:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ilxly at 2010-06-25 10:12:08:
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列

但是我这个序列是一段随即的，我不确定它可以不可以编码基因啊。那怎么办？
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
3楼2010-06-25 10:13:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaminl

铁杆木虫 (知名作家)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
友情支持
回复此楼
Nevergiveup!
4楼2010-06-25 16:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
先比对，查找相关信息~再设计引物，上下游扩增，对了，你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核，你说清楚~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-06-25 16:53:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoxiao198439

银虫 (小有名气)
★ ★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-06-25 17:17:51
先扔到NCBI上做一下blast吧，看看是不是基因，跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊，因为有很多基因是不能翻译蛋白的，所以基因分成了编码基因和非编码基因，比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-06-25 17:05:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zemin_fang

木虫 (正式写手)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
ORF Finder
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-06-25 17:38:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjxlqr2008

金虫 (初入文坛)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
Each gene can function specific protein, and work independently,  gene ,no matter what it is has specific region called encoding sequence and non-encoding sequence,
encoding region will function corresponding protein, nonencoding region will be spliced during transciption stage, that's called RNA splicing.
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-06-25 17:57:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liyong1981 at 2010-06-25 16:53:59:
先比对，查找相关信息~再设计引物，上下游扩增，对了，你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核，你说清楚~

我主要是做真核生物的多样性，目前找到同种不同菌株的一段相似序列，大约1100bp，它们在这段序列上的碱基差异可以找到，但是我想进一步知道这段序列是不是编码某个基因，这个怎么查啊。谢谢
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
9楼2010-07-02 20:18:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao198439 at 2010-06-25 17:05:02:
先扔到NCBI上做一下blast吧，看看是不是基因，跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊，因为有很多基因是不能翻译蛋白的，所以基因分成了编码基因和非编码基因，比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。

我现在的序列1100bp左右，就是想知道它是不是基因，以及是编码基因还是非编码基因。这个应该怎么做啊？请高手指点
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
10楼2010-07-02 20:26:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ahui1883 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭