24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2393  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构已有8人参与

最近测序获得一段序列,想知道其中是不是含有编码基因的序列,还有就是编码什么基因,这个应该怎么查找啊。请各位大侠帮忙,不胜感激啊。
回复此楼
海阔凭鱼跃,天高任鸟飞。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by liyong1981 at 2010-06-25 16:53:59:
先比对,查找相关信息~再设计引物,上下游扩增,对了,你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核,你说清楚~

我主要是做真核生物的多样性,目前找到同种不同菌株的一段相似序列,大约1100bp,它们在这段序列上的碱基差异可以找到,但是我想进一步知道这段序列是不是编码某个基因,这个怎么查啊。谢谢
海阔凭鱼跃,天高任鸟飞。
9楼2010-07-02 20:18:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

ilxly

木虫 (小有名气)


ahui1883(金币+1):谢谢参与
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列
2楼2010-06-25 10:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ilxly at 2010-06-25 10:12:08:
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列

但是我这个序列是一段随即的,我不确定它可以不可以编码基因啊。那怎么办?
海阔凭鱼跃,天高任鸟飞。
3楼2010-06-25 10:13:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)



ahui1883(金币+1):谢谢参与
先比对,查找相关信息~再设计引物,上下游扩增,对了,你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核,你说清楚~
5楼2010-06-25 16:53:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见